1、简介 Loupe Browser是⼀款10xGenomics开发的交互式桌⾯应⽤程序,⽤于探索10x单细胞数据,可以用来找出感兴趣的细胞、找出显著差异表达的基因、鉴定细胞类型、探索细胞亚类和数据共享。缺点是Loupe Browser不支持进阶分析,需要更多个性化分析的零代码操作可参考:一文学会零代码单细胞分析 软件下载地址:https://ww...
今天,我们来介绍一个生信小白也可操作的软件—— Loupe Browser,这款软件是10x genomics 公司为单细胞转录组数据分析提供的专门的分析结果查看软件。运行该软件需有 cellranger 输出的 *.cloupe 文件。接下来,…
1 简介 Loupe Browser是⼀款10xGenomics开发的交互式桌⾯应⽤程序,⽤于探索10x单细胞数据,可以用来找出感兴趣的细胞、找出显著差异表达的基因、鉴定细胞类型、探索细胞亚类和数据共享。缺点是Loupe Browser不支持进阶分析,需要更多个性化分析的零代码操作可参考:一文学会零代码单细胞分析 软件下载地址:https://www...
一．软件介绍 10X genomics 公司不仅为单细胞转录组数据分析提供了配套的 cell Ranger 软件，同时也提供了专门的分析结果查看软件-Loupe Cell Browser，该软件是一个图形界面的软件，操作非常的方便，支持 windows 和 mac 两种操作系统，下载地址如下：https://support.10xgenomics.com/single-cell-gene-expression/softw...
实用干货 | 可视化软件 Loupe Browser 的使用 今天,我们来介绍一个生信小白也可操作的软件——Loupe Browser,这款软件是10x genomics 公司为单细胞转录组数据分析提供的专门的分析结果查看软件。运行该软件需有 cellranger 输出的 *.cloupe 文件。 接下来,我们详细介绍一下该软件~...
今天,我们来介绍一个生信小白也可操作的软件——Loupe Browser,这款软件是10x genomics 公司为单细胞转录组数据分析提供的专门的分析结果查看软件。运行该软件需有 cellranger 输出的 *.cloupe 文件。 接下来,我们详细介绍一下该软件~ 01软件下载与安装
数据可视化利器——loupe browser操作宝典 一.软件介绍 10X genomics 公司不仅为单细胞转录组数据分析提供了配套的 cell Ranger 软件,同时也提供了专门的分析结果查看软件-Loupe Cell Browser,该软件是一个图形界面的软件,操作非常的方便,支持 windows 和 mac 两种操作系统,下载地址如下:https://support.10xgenomics....
今天,我们来介绍一个生信小白也可操作的软件——Loupe Browser,这款软件是10x genomics 公司为单细胞转录组数据分析提供的专门的分析结果查看软件。运行该软件需有 cellranger 输出的 *.cloupe 文件。 接下来,我们详细介绍一下该软件~ 01软件下载与安装 ...
在cell ranger软件的输出结果中,有一个名为cloupe.cloupe的文件,该文件就是用于输入到Loupe Cell Browser软件中的。 通过左上角的File->Open File, 或者Browser for a Loupe Cell Browser File菜单,导入对应的后缀cloupe的文件,导入成功后的页面如下
打开Loupe Cell Browser。 点击“File” -> “Open”。 选择您要导入的数据文件(通常是filtered_feature_bc_matrix.h5)。 点击“Open”按钮,Loupe Cell Browser将自动加载数据。 3. 数据可视化 Loupe Cell Browser提供了多种可视化工具,帮助您探索单细胞转录组数据。