相比于简单的log2(x+1)变换,vst转换通常具有更好的数据分布性质和更高的准确性,因此在生物信息学分析中被广泛使用。 tpm(transcripts per million)是一种常用的RNA-seq表达量数据单位,用于将基因表达量进行标准化,使得不同基因和不同样本之间的表达量具有可比性。tpm值的计算依赖于基因的长度和对齐的reads数,不同...
完美兼容「ggplot2」语法；下面来简单介绍一下，具体请查看作者官方文档 地址：https://github.com/ddsj...
使用TCGA-LIHC数据集,未进行任何样本过滤。 load("D:/data/TCGA/TCGAbiolinks-EXP/TCGA-LIHC-GeneSymbol.Rdata") expr_eset <- log2(exp_TPM + 0.1) expr_eset <- expr_eset[apply(expr_eset,1,sd) > 0.5,] #dim(expr_eset) library(IOBR) ###Method: ESTIMATE res_estimate <- deconvo_tme(eset...
董事长是不是有点奶狗系男友那味儿#国博文 #听泉 董事长是不是有点奶狗系男友那味儿#国博文 #听泉 84 谁懂啊真的很爱看他吃饭#听泉鉴宝直播回放 #听泉赏宝 谁懂啊真的很爱看他吃饭#听泉鉴宝直播回放 #听泉赏宝 19 想要一个全是表情包的评论区@博文加点油🙂↔️ @听泉赏宝 #听泉赏宝 #国博...