fpkm为基因表达量的值,测序结果通常给出测出的所有基因的表达量值,通常FPKM值横跨10^-2到10^4六个数量级。FC为两样本(组)基因间的比值,在转录组测序中,早期样本组1,某基因平均FPKM值为455,中期样本组2,某基因平均FPKM值为100, 这个基因在样本组1、2之间的FC=455/100.=4.55 取log2FC...
在log2fc足够大且fpkm也大于10的情况下,如果p值大于0.05,我们不能认为基因在两个条件之间有显著差异表达。这是因为p值是衡量差异表达是否显著的指标,通常情况下,p值小于0.05被认为是显著差异表达的阈值。但当log2fc和fpkm都比较高时,说明基因在两个条件中表达量差异很大,因此p值即使稍微大一些...