fpkm为基因表达量的值，测序结果通常给出测出的所有基因的表达量值，通常FPKM值横跨10^-2到10^4六个数量级。FC为两样本（组）基因间的比值，在转录组测序中，早期样本组1，某基因平均FPKM值为455，中期样本组2，某基因平均FPKM值为100， 这个基因在样本组1、2之间的FC=455/100.=4.55 取log2FC...
R语言中FPKM数据log2转换 1、1,语言,统计、绘图与编程,2,第1章 R 简介-什么是R?,图1 R首页的图形 R是一种统计绘图语言,也指实现该语言的软件。,The R Project for Statistical Computing,3,简史,R语言是从S统计绘图语言演变而来,可看作S的“方言”。 S语言上世纪70年代诞生于贝尔实验室,由Rick Becker,...
在log2fc足够大且fpkm也大于10的情况下，如果p值大于0.05，我们不能认为基因在两个条件之间有显著差异表达。这是因为p值是衡量差异表达是否显著的指标，通常情况下，p值小于0.05被认为是显著差异表达的阈值。但当log2fc和fpkm都比较高时，说明基因在两个条件中表达量差异很大，因此p值即使稍微大一些...