下面是使用excel进行log2 fold change计算的具体步骤: 1. 将两组样本的原始表达水平数据存储在excel表格中的两列,假设分别为A列和B列。 2. 在excel表格中另外创建一列,命名为log2 fold change。 3. 在log2 fold change列中输入计算公式: =log2(A2) - log2(B2) 4. 按下回车键,即可得到A列和B列对应行...
logFC,全称是log2 foldchange。foldchange可以代表变化倍数,如果处理组的表达均值是8;对照组的表达均值是2,那么foldchange就是4。而log2 fold change就是2。所以我们默认的logFC > 1,则代表两组之前差异在2倍以上的为有意义。logFC的绝对值, 由于相较于对照组,基因的变化并不一定是升高的。也有降低的。
2.准备数据集 使用excel准备数据集(这里用的是R语言对芯片数据或者测序数据进行差异分析的结果),如下 DEG数据集 左边为基因转化好的基因symbol,右边一列为排序的值,这里为基因差异分析的log2FoldChange值,然后另存为制表符分隔的文本文件。保存后,将其后缀改为.rnk这样数据就准备完毕。 3. 加载数据 将准备好的pre...
在RNA-seq数据中,log2FC(log2 fold change)是一种常用的指标,用于衡量基因在不同条件下的表达水平变化程度。log2FC的计算公式为log2(条件B的基因表达水平/条件A的基因表达水平)。 当在RNA-seq数据中观察到负的log2FC正在上升时,表示在条件B相对于条件A下,某个基因的表达水平呈现出逐渐增加的趋势,但是这个增加...
各位大神请赐教,急急急,R语言怎么筛选log2FoldChange绝对值>1同时P_value<0.05的行? 如文件数据, 需要输出数据 尽量详细,谢谢谢谢谢谢谢谢 分享2赞 中世纪2全面战争吧 Yulei0301 优化9过场时总是跳出求大神解决。另附system.log17:36:45.915 [system.rpt] [always] CPU: SSE2 17:36:45.915 [system.rpt] [...
Word, Excel, and PowerPoint Standards Support Word, Excel, and PowerPoint Standards Support [MS-OI29500]: Office Implementation Information for ISO/IEC 29500 Standards Support [MS-OI29500]: Office Implementation Information for ISO/IEC 29500 Standards Support 1 Introduction 2 Conformance S...
Word, Excel, and PowerPoint Standards Support [MS-OE376]: Office Implementation Information for ECMA-376 Standards Support [MS-OE376]: Office Implementation Information for ECMA-376 Standards Support 1 Introduction 2 Conformance Statements 2 Conformance Statements 2.1 Normative Variations 2.1 N...
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在线等1 2700 -log3—— 是多少啊 2 100 就是(二分之一log3)二千七百分之一百 不然告诉我27的二分之一次方等于多少,怎么算得(忘记了) 分享23赞 excel吧 怎么用函数求1.01的多少次方等于2?急用,谢谢! 分享2赞 6d2吧 qq123037798 6D2能刷出log模式嘛?如题,调色太累了。想换A73,手上的新6D2又出手...