首先,我们需要明确问题的需求和输入。假设我们有一个数据集,其中包含了一组正态分布的数据,我们要计算这些数据的以log为底数的P值。 接下来,我们需要导入数据集并计算P值。我们可以使用R语言中的pnorm()函数来计算正态分布的P值。假设我们的数据集存储在一个名为data的向量中,我们可以使用以下代码来计算以log为...
标准的火山图常用于展示显著差异表达的基因,这里有两个关键词:显著是指P<0.05,差异表达一般我们按照Fold Change(倍数变化)>=2.0作为标准。 当我们拿到基因表达的P值和Fold Change后,为了用火山图展示结果,一般需要把倍数进行Log2的转化,比如某基因在实验组表达水平是对照组的4倍,log2(4)=2,同样的如果是1/4,也...