结果表明,miR-449amimics显著降低了野生型PEG10的荧光素酶活性,但对突变型PEG10荧光素酶活性没有影响。证明PEG10与miR-449a靶向结合。 文献四:PMID: 35110549;IF=9.685 (1)方法 (2)结果 验证PAARH和HOTTIP分别与六种miRNA的结合。以上结果显示,miRNA转染组的荧光活性显著降低,表明miRNA与PAARH和HOTTIP之间存在靶...
miR-411-3p和miR-24-3p在GCSCs和GCNSCs中的表达谱。 使用microT、miRmap和TargetScan预测miRNA的潜在靶基因。 验证GCSC中miRNA的过表达。 检测miRNA过表达的GCSC中靶基因表达水平。 通过双荧光素酶报告基因测定验证miRNA与靶基因的互作。 GCSCs和GCNSCs中miRNA靶基因的表达水平。 GCSC和GCNSC中miRNA靶基因的Western ...
但是miRNA和snoRNAs的非编码初级转录本也可以具有功能，并且rRNAs、tRNAs和snoRNAs经过处理生成小的调控RNA...
需要注意的是,lncRNA的Trans作用靶基因预测只适合于样本量大的情况,如果样本量太少(如6个以下),分析将不可靠。 图4.lncRNA-mRNA共表达网络图分析示意图 3.3 LncRNAantisense分析 除了Cis作用和Trans作用调控,LncRNA参与调控许多转录后进程时,与miRNA和snoRNA等小RNA类似的,这些调控往往与碱基的互补配对有关。一部分...
2.1 通过 RNAhybrid 软件预测哪些miRNA会作用ATG7。 2.2 过表达这些miRNA,发现miR-188-3p作用最明显。(功能互作) 2.3 荧光素酶报告实验进行验证,看看两者是否结构互作。 3.miR-188-3p抑制细胞自噬。作者这里还做了细胞和动物实验,进行体外和体内验证。(不同的研究方向检测的指标不同,但是研究方法是相同的) ...
使用microT、miRmap和TargetScan预测miRNA的潜在靶基因。 验证GCSC中miRNA的过表达。 检测miRNA过表达的GCSC中靶基因表达水平。 通过双荧光素酶报告基因测定验证miRNA与靶基因的互作。 GCSCs和GCNSCs中miRNA靶基因的表达水平。 GCSC和GCNSC中miRNA靶基因的Western Blot。
使用microT、miRmap和TargetScan预测miRNA的潜在靶基因。 验证GCSC中miRNA的过表达。 检测miRNA过表达的GCSC中靶基因表达水平。 通过双荧光素酶报告基因测定验证miRNA与靶基因的互作。 GCSCs和GCNSCs中miRNA靶基因的表达水平。 GCSC和GCNSC中miRNA靶基因的Western Blot。
4. lncRNA-miRNA-mRNA调控网络的构建：结合KEGG和软件分析的结果，建立相应的lncRNA-miRNA-mRNA相互作用网络。想研究lncRNA–miRNA–mRNA调控网络预测的小伙伴们可以用此套路。本研究在多个基因组平台上进行了全面的数据挖掘，证明了FOXD2-AS1/miR-139-5p/BLVRA或CYTH2可促进肝硬化肝癌的形成。靶向FOXD2-AS1/miR-...
根据ceRNA调控机制,在编码基因的转录本上mRNA存在多种microRNA的应答元件MRE,miRNA可通过MRE与mRNA结合,导致mRNA降解或者抑制其翻译,所以说,miRNA在细胞内的调控功能主要是以负调控方式来调节基因的表达水平。 当lncRNA与mRNA存在相同的MRE时,他们之间构成了竞争相同种类miRNA的关系,细胞内lncRNA表达水平的高低,直接影响...
l靶基因预测与验证：使用生物信息学工具预测miRNA的靶mRNA，并通过双荧光素酶报告系统、RNA免疫共沉淀（...