结果表明,miR-449amimics显著降低了野生型PEG10的荧光素酶活性,但对突变型PEG10荧光素酶活性没有影响。证明PEG10与miR-449a靶向结合。 文献四:PMID: 35110549;IF=9.685 (1)方法 (2)结果 验证PAARH和HOTTIP分别与六种miRNA的结合。以上结果显示,miRNA转染组的荧光活性显著降低,表明miRNA与PAARH和HOTTIP之间存在靶...
miR-411-3p和miR-24-3p在GCSCs和GCNSCs中的表达谱。 使用microT、miRmap和TargetScan预测miRNA的潜在靶基因。 验证GCSC中miRNA的过表达。 检测miRNA过表达的GCSC中靶基因表达水平。 通过双荧光素酶报告基因测定验证miRNA与靶基因的互作。 GCSCs和GCNSCs中miRNA靶基因的表达水平。 GCSC和GCNSC中miRNA靶基因的Western ...
预测肝硬化患者肝癌发生的候选lncRNA-miRNA-mRNA网络:综合生物信息学分析 摘要 目的：本研究通过生物信息学分析，探索潜在的竞争性内源性RNA (ceRNA)网络在肝硬化患者HCC发展中的作用。方法：利用GEO和TCGA数据库的数据挖掘，挖掘mRNA、lncRNA和miRNA差异表达谱。在匹配的HCC队列中，RT-PCR证实了他们的表达(n = 6/...
2.1 通过 RNAhybrid 软件预测哪些miRNA会作用ATG7。 2.2 过表达这些miRNA,发现miR-188-3p作用最明显。(功能互作) 2.3 荧光素酶报告实验进行验证,看看两者是否结构互作。 3.miR-188-3p抑制细胞自噬。作者这里还做了细胞和动物实验,进行体外和体内验证。(不同的研究方向检测的指标不同,但是研究方法是相同的) 其实做到...
需要注意的是,lncRNA的Trans作用靶基因预测只适合于样本量大的情况,如果样本量太少(如6个以下),分析将不可靠。 图4.lncRNA-mRNA共表达网络图分析示意图 3.3 LncRNAantisense分析 除了Cis作用和Trans作用调控,LncRNA参与调控许多转录后进程时,与miRNA和snoRNA等小RNA类似的,这些调控往往与碱基的互补配对有关。一部分...
并且rRNAs、tRNAs和snoRNAs经过处理生成小的调控RNA，包括miRNA 11 - 14，在某些情况下有助于跨代表...
首先，利用targetFinder预测了miRNA、mRNA和lncRNA的靶标基因，即miRNA-mRNA和miRNA-lncRNA靶标基因的关系...
使用microT、miRmap和TargetScan预测miRNA的潜在靶基因。 验证GCSC中miRNA的过表达。 检测miRNA过表达的GCSC中靶基因表达水平。 通过双荧光素酶报告基因测定验证miRNA与靶基因的互作。 GCSCs和GCNSCs中miRNA靶基因的表达水平。 GCSC和GCNSC中miRNA靶基因的Western Blot。
根据ceRNA调控机制,在编码基因的转录本上mRNA存在多种microRNA的应答元件MRE,miRNA可通过MRE与mRNA结合,导致mRNA降解或者抑制其翻译,所以说,miRNA在细胞内的调控功能主要是以负调控方式来调节基因的表达水平。 当lncRNA与mRNA存在相同的MRE时,他们之间构成了竞争相同种类miRNA的关系,细胞内lncRNA表达水平的高低,直接影响...
需要注意的是,lncRNA的Trans作用靶基因预测只适合于样本量大的情况,如果样本量太少(如6个以下),分析将不可靠。 图4.lncRNA-mRNA共表达网络图分析示意图 3.3 LncRNAantisense分析 除了Cis作用和Trans作用调控,LncRNA参与调控许多转录后进程时,与miRNA和snoRNA等小RNA类似的,这些调控往往与碱基的互补配对有关。一部分...