PyMol依赖于Python环境,因此需要确保系统中已经安装了Python。可以通过以下命令检查Python的版本: bash python --version 或者,如果你的系统中同时安装了Python 2和Python 3,你可能需要使用: bash python3 --version 3. 使用包管理器安装PyMol 对于某些Linux发行版,如Ubuntu或基于Debian的系统,你可以尝试使用包管理...
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提取方法:将该python脚本复制到out_log文件夹中,使用命令 python3 extract_affinity.py运行结束后会得到一个名为affinity.out的文件,再将这个文件传到Windows电脑上,用excel打开,将一列数据拆分为两列(小分子编号,亲和力值),使用排序功能即可找到亲和力最高的小分子编号。根据编号再去找到相应的小分子mol2以及对接结果...
在linux下安装autodock，安装完MGLTools，终端输入adt，没有界面显示，提示：import error：the _imaging...
3. I used MacPyMOL to made the two movies. Cartoon mode Ball and stick mode Comments (1) November 6, 2012 [Modeller] point mutation script Filed under:softwares and scripts— kpwu @ 10:41 pm Tags:modeller,mutation,python Saw a script provided by Modeller that can quickly mutate a point...