命令是: unzip bowtie2-2.3.2-source.zip 解压安装包 gmake NO_TBB=1 编译安装 对于下面两个,只需解压缩即可使用: unzip bowtie2-2.3.2-linux-x86_64.zip unzip bowtie2-2.3.2-legacy-linux-x86_64.zip 随后添加环境变量: #bowtie2 export PATH=/home/user/Programs/bowtie2-2.3.2-***:$PATH 即...
2.1 下载bowties2 http://bowtie-bio.sourceforge.net/bowtie2/index.shtml 然后选择版本后,安装并加到环境变量中 2.1.1.现在Bowtie2安装包: bowtie2-2.3.4.3-linux-x86_64.zip 2.1.2.将安装包放在指定的文件目录下,并进行解压缩: unzip bowtie2-2.3.4.3-linux-x86_64.zip 2.1.3.配置环境变量: vi ...
一般,帮助文档出来就说明软件安装成功 # 通过绝对路劲执行软件(不加任何参数,就会打印帮助文档) shiyanlou:bowtie2-2.4.5-linux-x86_64/ $ /home/shiyanlou/biosoft/bowtie2/bowtie2-2.4.5-linux-x86_64/bowtie2 No index, query, or output file specified! Bowtie 2 version 2.4.5 by Ben Langmead (...
命令是: unzip bowtie2-2.3.2-source.zip 解压安装包 gmake NO_TBB=1 编译安装 对于下面两个,只需解压缩即可使用: unzip bowtie2-2.3.2-linux-x86_64.zip unzip bowtie2-2.3.2-legacy-linux-x86_64.zip 随后添加环境变量: #bowtie2 export PATH=/home/user/Programs/bowtie2-2.3.2-***:$PATH 即...
~/biosoft/bowtie2$ wget https://sourceforge.net/projects/bowtie-bio/files/bowtie2/2.3.5.1/bowtie2-2.3.5.1-linux-x86_64.zip/download 解压文件 $ unzip bowtie2-2.3.5.1-linux-x86_64.zip 下面把bowtie2写入bashrc,以便以后随便哪个目录都可以调用 ...
Bowtie也可以在服务器计算机上远程使用。我们将提供临时帐户访问CSC，但你将需要一个安全Shell终端程序进行通信。默认情况下，Mac和Linux上都有这样的程序，但需要安装Windows。普遍的实现是PuTTY。即使终端程序不用于读取映射，也将需要其他练习，并且应该可用。Bowtie的安装：从下载页面下载相应的版本(Linux，...
1.安装bowtie2 (base):~$ conda install bowtie2 出现下面则安装成功 Collecting package metadata (current_repodata.json): done Solving environment: done ## Package Plan ## environment location: /home/hanwq/anaconda3 added / updated specs: ...
例如:使用conda install seqtk或conda create --name seqtk seqtk安装seqtk包。
apt-get install -y make # Rbowtie2 requirements: apt-get install -y make # Rbowtie requi...
unzip bowtie2-2.3.4.1-linux-x86_64.zip mv bowtie2-2.3.4.1-linux-x86_64 bowtie2 echo 'export PATH=/usr/local/bowtie2:$PATH' >> ~/.bashrc source ~/.bashrc #生效环境变量 #验证安装是否成功 bowtie2 --version 1. 2. 3. 4.