短序列有参比对常用的软件有BWA、Bowtie、BBMap等。下面以Bowtie 2为例。 3.3K30宏基因组多样品的混合组装 一般来说,宏基因组测序数据量越大越有利于序列组装,要想深入了解微生物群落往往需要深度测序,然而对于项目中大批量的样品,受制于成本每个样品的测序量不会很大;此外,对于动物组织等特殊样本,去掉宿主序列...