我们可以在NCBI中下载本地版BLAST程序: Index of /blast/executables/blast+/LATESTftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 可供下载的最新版BLAST程序 本教程是在Linux系统上运行BLAST程序,因此选择Linux版本下载即可。 下载完成以后,需要在Linux系统中将软件的压缩包进行解压: tar -xzf 文件名...
BLAST程序是用于在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具。它能在极短时间内将序列与公开数据库进行比较，并计算匹配的统计显著性。此工具可用于识别序列之间的功能和进化关系，以及发现基因家族成员。BLAST程序提供了五种工具以供选择。它适用于Linux系统，用户需从NCBI下载本地版本的程序。下...
在ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/中下载最新的BLAST可执行程序(不要下载源代码`,源码编译非常慢),选择预编译版本,如ncbi-blast-2.2.30+-x64-linux.tar.gz。如果服务器能联网,可直接用wget下载。或者,下载后用SFTP客户端传输到服务器上。 wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/...
1、把BLAST的压缩文件解压，然后将bin目录下的文件拷贝至/usr/local/bin下；2、制作软链接，将解压后的文件中bin目录链接至/home/username下，eg：ln -s /home/username/blast/bin；3、在当前用户目录下，编辑bashrc文件，在文件中加入export PATH=/home/username/bin/=$PATH;4、在当前目录下，将数...
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此外，biopython 里面也有 blast 相关的方法。做大量 blast 时很好用。下面是官方的文档。http://...
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