安装好conda后,设置环境变量 vim ~/.bashrc 添加 alias liuzhenPython='/home/riki/anaconda3/bin/python' export PATH="/home/riki/anaconda3/bin:$PATH" 然后source source ~/.bashrc 检验ok
conda config --add channels https://mirrors.pku.edu.cn/anaconda/pkgs/main/ 9,再按命令“conda config --show”可以再查看当前的镜像。 10,我们现在设置环境变量,这个操作可以使我们在任何文件目录下使用conda命令,不必进入bin文件夹中使用软件,为以后使用conda安装软件提供便利。首先在home下查看当前的环境变量:...
首先,我们需要安装conda。conda是一个应用商店,可以通过它来安装各种生信软件,并设置镜像和环境变量。具体步骤如下: 打开终端:在Linux系统中,终端是命令行界面,我们需要在这里输入命令来安装conda。 更新软件包列表:在终端中输入以下命令,更新软件包列表到最新版本。 sudo apt-get update 安装miniconda:输入以下命令,根...
(不保存退出,很常用,我不小心编辑错了环境变量,所以经常用 ESC ,然后输入 :q! ) 见下图左下角是不保存退出, 保存退出: 如下图 回到字符交互界面: 输入:conda ok,解决问题。 测试python3 输入python3,想要退出输入直接快捷键:ctrl+D
conda install gatk 只能安装3.0版本,如果需要4.0,只能老老实实自己下载安装。 1、下载4.0+版本 wget https://github.com/broadinstitute/gatk/releases/download/4.1.8.1/gatk-4.1.8.1.zip 2、解压 unzip *.zip 3、gatk 不需安装,解压即可使用。 gatk --help#若能出现下图,证明安装成功。
连接服务器我用MobaXterm。另外一些Linux基础,如创建文件和文件夹等,就不说了。我们来看看在拥有服务器账号后,如何安装conda,conda是一个应用商店,可以通过这个软件来安装各种生信软件,并设置镜像和环境变量。 2,首先进入一个文件夹,这个文件夹所分配的存储空间一定要大...
连接服务器我用MobaXterm。另外一些Linux基础,如创建文件和文件夹等,就不说了。我们来看看在拥有服务器账号后,如何安装conda,conda是一个应用商店,可以通过这个软件来安装各种生信软件,并设置镜像和环境变量。 2,首先进入一个文件夹,这个文件夹所分配的存储空间一定要大...
连接服务器我用MobaXterm。另外一些Linux基础,如创建文件和文件夹等,就不说了。我们来看看在拥有服务器账号后,如何安装conda,conda是一个应用商店,可以通过这个软件来安装各种生信软件,并设置镜像和环境变量。 2,首先进入一个文件夹,这个文件夹所分配的存储空间一定要大...
另外一些Linux基础,如创建文件和文件夹等,就不说了。我们来看看在拥有服务器账号后,如何安装conda,conda是一个应用商店,可以通过这个软件来安装各种生信软件,并设置镜像和环境变量。 2,首先进入一个文件夹,这个文件夹所分配的存储空间一定要大 cd /data/username/ 3,在该文件夹中,下载Miniconda,下载命令: wget ...