液相色谱-质谱(LC-MS)数据分析通常遵循以下流程: 一、数据预处理: 1.首先,对原始的LC-MS数据进行预处理,包括峰检测、峰识别和峰提取。这一步骤可以通过使用专业的数据处理软件或编程语言来完成。 2.接下来,进行信号去噪处理,以去除噪声和杂质信号,提高数据质量和分析结果的准确性。
1.获取原始数据:根据不同机器测出来的结果,原始数据格式不同,比较常见的有.WIFF和.RAW。用相关的软...
2.统计分析:主要包含单统计分析 (Fold change、T test、Volcano Plot 等) 及多统计分析 (PCA、HCA、PLS-DA 等),也可辅以机器学习建模的方法,一般是通过寻找差异表达的代谢物从而锁定与研究背景相关的目标物质。 3.代谢物鉴定: 目的是将 LC-MS 检测信号匹配到对应代谢物,分为标准品数据库比对和算法预测两种方式...
LC-MS非靶向代谢组学的原始下机数据得到的质谱图,将原始数据表达量导入QI软件获得定性定量结果,针对定性结果来做QC样本质控评判仪器的稳定性。 图| 非靶向LC-MS代谢组学分析流程 定性结果表格解析 QI软件定性后的结果为CSV格式,其中LC-MS下机是有正负离子两套数据. 定性结果:是将物质峰在相应的库中定性匹配。定...
LC-MS工作流程包括三个步骤:首先,样品通过流动相在色谱柱中分离,分析物的流出时间(RT)与它们的化学性质相关;其次,LC分离的化合物通过检测器,如折射率或光吸收率检测器,形成峰,峰的强度反映样本中的化合物含量;最后,MS用于离子化并根据质量比值对离子进行分离,通过绘制总离子色谱图(TIC)和...
LC-MS/MS定量分析流程与经验 第一步: Q1 SCAN——确定母离子的质荷比 ●根据待测化合物性质,选择分析的极性(+/-)、离子化方式(ESI/APCI),根据分子量选择扫描范围和时间 ●确定母离子的质荷比,准确到小数点后一位。 参数设置: 扫描方式:Q1 Scan ...
三、LC-MS和LC-MS/MS的流程 LC-MS:样品准备 → 液相色谱分离 → 质谱分析 → 数据处理和解释 LC-MS/MS:样品准备 → 液相色谱分离 → 第一级质谱分析(MS1)→ 离子选择和碎裂 → 第二级质谱分析(MS2)→ 数据处理和解释 四、LC-MS和LC-MS/MS应用对比 ...
LC-MS的工作流程可以分为三个关键步骤:液相色谱分离、液相色谱检测和质谱分析。首先,通过LC分离目标化合物。样品溶液以微升量注入流动相,并通过填充有固定相的色谱柱。样品成分与固定相之间的作用力导致它们在色谱柱中按物理性质或化学组成分离。随后,通过检测器收集分离的流动相,检测器响应分析物的物理...
二、实验流程 辅酶A代谢组学分析是研究辅酶A在生物体内的代谢状态和相关代谢途径的一种方法。以下是辅酶A代谢组学分析的一般流程: 需要注意的是,具体的实验流程可能会因研究目的、样品类型和使用的技术平台而有所不同。以上流程仅为一般参考。 三、应用方向和技术优势 ...
若其分子质量刚好增加了磷酸基团的值,就可以判定该蛋白发生了磷酸化修饰。利用LC-MS鉴定蛋白磷酸化的大致流程为将待测蛋白样品酶解消化为小分子肽段并依次进行色谱-质谱检测,结合生物信息学方法以及相关软件数据库对各肽段的质谱数据进行分析,可以鉴定各肽段的分子质量,从而判定其是否含有磷酸基团。