“` lammps -in inputfile “` 其中,`inputfile`是你创建的输入文件的名称。这个命令会启动LAMMPS,并将输入文件作为参数传递给LAMMPS。 4. 查看输出结果:LAMMPS将在运行完成后在终端窗口中显示输出结果。你可以查看模拟过程中的能量值、力值、坐标等参数的变化。此外,LAMMPS还可以将输出结果写入到文件中,以便后续分...
下面是一个使用Lammps进行分子模拟的示例代码: importjava.io.IOException;publicclassLammpsIntegration{publicstaticvoidmain(String[]args){try{ProcessBuilderprocessBuilder=newProcessBuilder("lammps","-in","inputfile");Processprocess=processBuilder.start();// 获取命令的输出结果intexitCode=process.waitFor();System...
lammps案例:晶界形成过程模拟 分享一个金属晶界生成的lammps模拟代码,主要原理是生成不同取向的两部分晶体,通过能量最小化得到晶界结构。 in文件代码: # LAMMPS Input File for Grain Boundaries # Mark Tschopp, Dec2009 # This file will generate numerous input files for LAMMPS # using a large number of gra...
lammps -in input_file.in ``` 其中,`input_file.in`是我们准备的输入文件名。运行后,LAMMPS将开始模拟并输出一系列结果,包括能量、压力、温度等。为了计算分子数,我们可以使用LAMMPS的自定义计算功能。下面是一个示例计算分子数的输入文件: ``` # LAMMPS input file for molecular dynamics simulation # Initiali...
分享一个金属晶界生成的lammps模拟代码,主要原理是生成不同取向的两部分晶体,通过能量最小化得到晶界结构。 in文件代码: #LAMMPSInputFileforGrainBoundaries#MarkTschopp,Dec2009#ThisfilewillgeneratenumerousinputfilesforLAMMPS#usingalargenumberofgrainboundaries#--- Setup Variables ---variableetolequal1.0e-25variable...
lmp_serial < inputfile 其中,inputfile是前面生成的输入文件的名称。LAMMPS开始运行后,将自动执行输入文件中定义的模拟计算程序。 3. 提取晶格常数 模拟计算完成后,需要提取晶格常数的数值。在LAMMPS输出中,可以找到很多关于晶体系统的参数信息,包括能量、压力、密度和温度等。为了获取晶格常数,需要计算晶体的晶格参数,...
然后5.3.1. GPU package在这里可以找到使用GPU加速的指令, 1.在command line里面加上-sf gpu,这个指令是把原来的input file转变成适合gpu的input file。 然后-pk gpu # (package, gpu #Ngpu数量) 2.在input file里面的force filed后面加上/gpu 具体可以查看lammps手册。 CMAKE !!! 2019.1.5 Darmstadt,DE ...
其中,inputfile是您的LAMMPS输入文件的名称,num_procs是您希望使用的处理器核心数量。 注意:如果您的LAMMPS输入文件需要使用并行计算,请确保您的系统已经正确配置了MPI(Message Passing Interface)。 4. LAMMPS开始运行,并生成输出结果。您可以根据自己的需求,在输入文件中指定输出文件的名称和格式。
1.1 LAMMPS input script 我们用lammps做分子动力学模拟, 需要一个输入文件. lammps在执行计算的时候, 从这个文本文件中逐行读入命令. 大多数情况, lammps输入文件中各个命令的顺序并不是很重要. 但是你要注意以下几点: (1) lammps并不是将你的输入文件全部读入之后才开始进行计算的, 或者说, 每条命令在它被读入...
1.1 LAMMPS input script 我们用lammps做分子动力学模拟,需要一个输入文件. lammps在执行计算的时候,从这个文本文件中逐行读入命令.大多数情况, lammps输入文件中各个命令的顺序并不是很重要.但是你要注意以下几点: (1) lammps并不是将你的输入文件全部读入之后才开始进行计算的,或者说,每条命令在它被读入之后就会起...