fix JJ all ave/correlate ${sam} ${cor} ${dum} c_flux[1] c_flux[2] c_flux[3] type auto file SLG_J.J_t${temp_s}.dat ave running #计算Green-Kubo公式系数 variable scale equal (${dt}*${sam})/(${kB}*${temp_s}^2*$A) #计算Green-Kubo公式 variable k11 equal (trap(f_JJ[...
lammps利用GreenKubo方法计算导热系数的案例，输入文件如下 # Sample LAMMPS input script for thermal ...
typeautofileSLG_J.J_t${temp_s}.dataverunning#计算Green-Kubo公式系数variablescaleequal(${dt}*${sam})/(${kB}*${temp_s}^2*$A)#计算Green-Kubo公式variablek11equal(trap(f_JJ[3])*${scale})*${convert}variablek22equal(trap(f_JJ[4])*${scale})*${convert}variablek33equal(trap(f_JJ[...
方法一,平衡态分子动力学(EMD),利用的是Green-Kubo方法对计算的相关物理量做卷积得到热导率: LAMMPS 脚本来自安装包中example/KAPPA/in.heatflux如下: # sample LAMMPS input script for thermal conductivity of liquid LJ # Green-Kubo method via compute heat/flux and fix ave/correlate # settings variable ...
在平衡态下计算热导率,主要计算公式为Green-Kubo。 用到的主要命令为compute heat/flux。 用法为: compute myFlux all heat/flux myKE myPE myStress 其中,myKE为原子动能,myPE为原子势能,myStress为原子应力。 在使用compute heat/flux命令前,必须提前计算出这三个量的值。
在平衡态下计算热导率,主要计算公式为Green-Kubo。 用到的主要命令为compute heat/flux。 用法为: compute myFlux all heat/flux myKE myPE myStress 其中,myKE为原子动能,myPE为原子势能,myStress为原子应力。 在使用compute heat/flux命令前,必须提前计算出这三个量的值。
在计算材料的热导率方面,LAMMPS主要使用非平衡态法(NEMD)和格林-库伦法(Green-Kubo)。 非平衡态法(NEMD)是通过在材料中引入温度梯度来计算热导率的。具体步骤包括: 1.在材料的两端施加不同的温度,产生一个温度梯度。 2.通过模拟原子在这个温度梯度下的运动轨迹,可以计算出材料的热导率。 格林-库伦法是通过...
LAMMPS是一种分子动力学模拟软件,可以用于模拟各种材料的物理和化学性质。其中,扩散系数是一个重要的物理量,它描述了分子在材料中的运动和扩散行为。本文将介绍LAMMPS中计算扩散系数的方法和应用。 LAMMPS中计算扩散系数的方法主要有两种:Einstein关系和Green-Kubo关系。Einstein关系是通过计算分子的平均位移和时间来计算扩散...
在Green–Kubo热导模拟中，我们详细设定了各项参数。首先，我们定义了热流（F）为0.075，步长（dt）为3.0，模拟总时间（tprod）为1000000。接下来，我们根据模拟时间计算了模拟步数（Nprod），以确保模拟的准确性。此外，还设定了SPC/E参数，包括能量参数（epsOO）、尺寸参数（sigOO）以及角度参数（theta），以描述...
在平衡态分子动力模拟中,可以用Green-Kubo方法[1,2]对热流自关联函数对一定关联时间进行积分以得到热导率: kuv(t)=VkBT2∫0t<Ju(0)Jv(t)>dt 上式中 kB、 V、 T 分别为玻尔兹曼常数、温度和模拟盒子的体积。 <Ju(0)Jv(t)> 是热流自关联函数在不同时间起点的平均。 LAMMPS中通过compute heat/flux...