在LAMMPS中,可以使用fix setforce命令来施加力。fix setforce命令语法格式为: fix ID group-ID setforce fx fy fz keyword value ... 其中: ID是本次fix设置的id,可以任意命名。group-ID是需要被施加力的原子组 fx、fy、fz是施加力的方向和大小。fix setforce原理是在xyz方向上设置原子新的受力值,如果某...
但是这个势能场略复杂,立场的F分解为Fx,Fy,Fz,这三个方向的力分别是被弹性系数K(x,x/y/z),K(y,x/y/z),K(z,x/y/z)支配。 比方说两个原子的系,分别为原子1和原子2,考虑原子1收到的力, F=(Fx,Fy,Fz)= (K(x,x)Ux+K(x,y)Uy+K(x,z)Uz, K(y,x)Ux+K(y,y)Uy+K(y,z)Uz, K...
AI检测代码解析 fix ID group-ID setforce fx fy fz keyword value ... 1. 其中: ID是本次fix设置的id,可以任意命名。 group-ID是需要被施加力的原子组 fx、fy、fz是施加力的方向和大小。 fix setforce原理是在xyz方向上设置原子新的受力值,如果某个方向不需要设置,可设为NULL。 AI检测代码解析 #将ind...
import pandas as pd # 读取LAMMPS的log文件 log_file = 'log.lammps' data = pd.read_csv(log_file, delim_whitespace=True, header=None, names=['Step', 'Temp', 'Etotal', 'Press', 'Fx', 'Fy', 'Fz']) # 打印前几行数据以验证读取结果 print(data.head()) # 进一步分析力数据(例如,计算...
约束类型参数args 约束类型数字参数P.S.①约束参数参见文档fix处,较为复杂https://lammps.sandia.gov/doc/Commands_fix.html②极小部分参数说明:nve 等容能量守恒过程nvh 等容等焓过程nvt 等容等温过程setforce 特定区域每个原子受力,NULL指某方向的力维持不变(语法:fix ID group-ID setforce fx fy fz ...
temp/berendsen 300.0 300.0 100.0fix 1 all press/berendsen iso 0.0 0.0 1000.0 fix 3 boundary temp/rescale 1 1.0 1.5 0.05 1.0 只调整原子的数度,不更新原子的位置(没有时间积分)所以需要结合nve使用, press/berendsen可结合nvt使用Fix setforceSyntax:fix ID group-ID setforce fx fy fz keyword value ....
dump 2 all cfg 2000 dump.relaxtion_*.cfg mass type xs ys zs c_csym c_peratom fx fy fz dump_modify 2 element Si # Run for at least 10 picosecond (assuming 1 fs timestep) run 100000 unfix 1 undump 2 # Store final cell length for strain calculations variable tmp equal "ly" var...
原子所受的力完全没什么意义，应该是要输出原子所受的应力才好 可以
variable fz equal f_3[3] fix 4 tetras print 1 "-- ${fx} ${fy} ${fz} --" #--- thermo 2 thermo_style custom step f_3[1] f_3[1] f_3[1] #--- 以上由redream/
命令：fix id group-ID addforce fx fy fz keyword value 这个命令就是给指定的群组（粒子群组）施...