fix MP_V wat viscosity 10 x z 200 #通过控制交换频率和每次交换的原子个数就能产生不同大小的动量流以及速度分布 run 1000000 #重置 fix viscosity reset_timestep 0 unfix MP_V fix MP_V wat viscosity 10 x z 200 compute layers_eta all chunk/atom bin/1d z lower 0.005 units reduced fix ave_T...
# Compute viscosity using Green-Kubo method compute msd all msd variable mu equal 0.5 * v_msd[4] / (6 * 10000 * 1.0e-6) print "Viscosity: ${mu}" ``` 上述输入文件首先设置了lammps的计算单位和边界条件。然后,指定了原子和键的类型,并读入了水的数据文件。接下来,设置了势函数以及相应的参数...
ERROR: Unrecognized compute style 'viscosity/cos' (../modify.cpp:1206)Last command: compute cos...
如上文所述,既然lammps应力的单位表现出能量的含义,那么转化为宏观意义上的应力则需要除以一个体积,那么这个体积该如何得到呢,这个却是没有定论的,就连lammps mannual中也提到: “but an individual atom’s volume is not well defined or easy to compute in a deformed solid or a liquid. See thecompute v...
(2)compute mytemp all temp/partial 0 0 1 命令中详细说明了和控温命令连用时指的是去除x和y方向由于viscosity命令生成的速度 ,减去两个方向的速度偏差,并对剩余热速度控温,此例子就是计算的100K下的粘度。 总的来说,x方向是剪切速度 、y方向是速度传递方向,二者均需要修正,fix nvt下的温度就是目标温度。
通过compute pressure命令 可以计算压力或应力张量的 Pxy 偏斜分量,同时也可以用来监视。 第三种方法是使用fix viscosity命令执行反向非平衡 MD 模拟,该方法是执 行 Muller-Plathe 的 rNEMD 算法。在两个不同层的原子之间的模拟盒子中,一维 动量与不同维度的动量进行交换。 这引发了一个速度梯度, 37、可以用 ...
The VISCOSITY directory has example scripts for computing the viscosity of a LJ liquid using 4 different methods. See the VISCOSITY/README file for more info.
单原子量可以使用 dump customor fix ave/spatial命令进行输出,也可以使用 fix ave/atom命令对时间进行平均,或使用compute reduce 命令进行降维,或使用atom-style类型的变量进行引用。 局域量可以使用compute reduce命令进行降维,或者使用fix ave/histo命令进行直方图化。
[BUG] pair_style lubricate does not support dynamically altering viscosity during simulationbug #4323 openedSep 11, 2024bysouvi-lrcs 1 [Feature Request] Add tester to check FFTsenhancementunittest_featurevolunteer_needed #4317 openedSep 6, 2024byakohlmey ...
模拟过程中通过下面的命令制定lammps进行各种计算:compute,compute_modify,variable.输出选项由thermo,dump,restart命令设置.fixIDgroup−IDstyleargs·ID=user−assignednameforthefixID是用自己定义的名字，便于通过fix定义·group−ID=IDofthegroupofatomstoapplythefixto·style=oneofalonglistofpossiblestylenames(...