apt install cmake apt install gfortran apt update apt upgrade fftw,如果不装自己制定的版本的话,会从lammps自带的快速傅里叶变换中编译,速度和表现都是一样的。 装并行的lammps首先需要安装mpich或者OpenMpi,这里以mpich为例。首先去mpich的官网下载mpich3的压缩包。 tar -zxvf mpich3.tar.gz #解压缩 ./confi...
下载lammps的安装包,官网LAMMPS Molecular Dynamics Simulator 进入cmake文件夹下,创建build文件夹 进入build文件夹,终端中敲入命令cmake .. 或者ccmake .. 意思是对上一级目录进行cmake 编译,ccmake是cmake的终端gui模式 以ccmake为例,敲入ccmake ..后进入到编译选项的界面,如下图所示 对自己需要的PKG进行勾...
安装准备：在拥有CentOS系统，且预装了openmpi、fftw等基础依赖的环境下，你需要从lammps官网下载lammps-stable.tar.gz安装包，以及CMake版本3.10以上。构建过程：解压lammps包后，进入文件夹，创建名为build的子目录。在build内，使用CMake进行配置，它会检测并启用MPI、OpenMP等支持。配置完成后，你会看到...
将lammps安装包解压后,进入所在文件夹,新建一个名为build文件夹,并在此文件夹内构建lammps。 cd lammps #change to the LAMMPS distribution directorymkdir build; cd build #create and use a build directorycmake ../cmake #configuration reading CMake scripts from ../cmakecmake --build . #compilation ...
0. 编译OpenMPI(对于多卡并行的情况可选),按需启用UCX、GPU-aware等特性,这不是本文重点,不赘述。 1. 在8月文章中提到: 对于RDNA GPU,需使用最新版Kokkos (4.1.0) 替换官方捆绑的Kokkos(lib/kokkos),并将cmake/CMakeLists.txt第146和147行的14改为17。
cmake -DBUILD_MPI=yes-DBUILD_OMP=yes-DMPI_C_COMPILER=/public/software/mpi/openmpi-16-intel/bin/mpicc -DMPI_CXX_COMPILER=/public/software/mpi/openmpi-16-intel/bin/mpicxx -DFFMPEG_EXECUTABLE=~/lammps_setup/ffmpeg-4.2-amd64-static/ffmpeg ...
update sudo apt-get install lammps gcc g++ gfortran cmake make build-essential ffmpeg libopenmpi-...
在6800XT的PC上编译LAMMPS 2Aug2023，同时包含GPU包和Kokkos包用于GPU加速。使用CMake+预设脚本进行编译...
将cmake加入到.bashrc环境变量文件中 二、下载相关依赖openmpi zlib hdf5 silo 依赖版本 openmpi3.1.2 zlib1.2.11 hdf51.8.12 silo4.10.2 依赖自行搜索下载 zlib安装: tar xvf zlib-1.2.11.tar.gz cd zlib-1.2.11 ./configure --prefix=/usr/local/zlib ...
cmake (比make智能/简单的源码构建工具) git (代码管理工具) gcc-core (c编译器) gcc-g++ (C++编译器) openssh (ssh服务器/客户端) openmpi (并行计算要用) wget (下载器) binutils (二进制文件构建工具包) bzip2 (压缩/解压工具) tar (压缩/解压工具) ...