lammps---v..LAMMPS分子动力学模拟技术与应用【录播】助力科研 助力科研 2024年12月02日 10:50 北京录播课LAMMPS分子动力学模拟技术与应用培训时间:长期招生(录播视频课程+群答疑指导+全部资料
LAMMPS 是现今先进的基于力场的分子动力学程序之一,由Dr. Steve Plimpton和他的团队在 Sandia国家实验室开发,能够采用大规模并行和支持GPU的计算机架构实现高效的基于力场的分子动力学计算模拟。 MedeA LAMMPS提供了LAMMPS 程序的图形界面,相比传统的LAMMPS程序,可以简化建模过程,节省时间,并自动生成模拟所需的命令,无需详...
(1)前缀v_ lammps中使用variable定义一个变量,类似与C语言中变量的定义。 如定义一个名为beta的变量: variablebetaequaltemp/3.0 要获取beta变量的值,不能直接用beta这个变量名,需要在变量名称的前面加前缀“v_": thermo100thermo_stylecustomstepv_beta (2)前缀c_ compute命令在lammps中主要是计算模拟过程中的一...
(1)前缀v_ lammps中使用variable定义一个变量,类似与C语言中变量的定义。 如定义一个名为beta的变量: variablebetaequaltemp/3.0 1. 要获取beta变量的值,不能直接用beta这个变量名,需要在变量名称的前面加前缀“v_": thermo100 thermo_stylecustomstepv_beta 1. 2. (2)前缀c_ compute命令在lammps中主要是计...
1、确保nvidia-smi和nvcc -V均正常 2、下载lammps https://download.lammps.org/tars/index.html(建议年份比较新的版本) 3、解压(这里以lammps-23Jun2022.tar.gz为例) tar -zxvf lammps-23Jun2022.tar.gz 4、编译lammps的gpu库 (1)cd lammps-23Jun2022/lib/gpu ...
$ https://lammps.sandia.gov/tars/lammps-stable.tar.gz 登录节点禁止运行作业和并行编译,请申请计算节点资源用来编译,并在编译结束后退出: $ srun -p g1_share -n56--pty /bin/bash# -p 参数指定了队列,请以实际使用为准 加载Intel 模块: $ module load intel/2022 intelmpi/2022 # intel 环境加载 ...
分子动力学模拟是一套数值模拟方法。该方法通过数值求解牛顿运动方程的方式,来获得系统中每个原子的位置及速度随时间的变化,从而可以获取我们所关心的物理量,如比热容、扩散系数、热导率等。简单的说,我们可以把分子动力学模拟当作在计算机上面完成的物理实验。但相比于真正的物理实验,分子动力学模拟可以获取更小空间尺度...
其中V(r)是势能与键长r之间的关系,D是势阱深度,a是振动频率,r0是平衡键长。 首先,我们需要准备一个初始的石墨烯晶胞。可以使用LAMMPS提供的工具生成一个石墨烯晶胞文件。然后,我们可以通过定义一个原子类型和键角类型,在输入文件中使用"read_data"命令来读取晶胞文件。在LAMMPS输入文件中,可以使用"pair_style"和"...
V(r) = q1*q2/(4πε0r) 其中,q1和q2分别为两个带电粒子的电荷量,ε0为真空介电常数,r为粒子之间的距离。在LAMMPS中,需要给定粒子的电荷量,以确定系统的相互作用。 4. Born-Mayer势参数 Born-Mayer势函数常用于描述离子晶体的相互作用,其形式如下: V(r) = A*exp(-B*r) - C/r^n 其中,A、B、...
lammps---v--pray5186 pray5186 LAMMPS分子动力学模拟技术与应用【录播】助力科研 助力科研 2024年12月02日 10:50 北京 录播课 LAMMPS分子动力学模拟技术与应用 培训时间:长期招生 (录播视频课程+群答疑指导+全部资料文件) LAMMPS是一款经典的分子动力学软件,免费开源,可以模拟液态、固态或气态的粒子的系综。目前...