LAMMPS 是现今先进的基于力场的分子动力学程序之一,由Dr. Steve Plimpton和他的团队在 Sandia国家实验室开发,能够采用大规模并行和支持GPU的计算机架构实现高效的基于力场的分子动力学计算模拟。 MedeA LAMMPS提供了LAMMPS 程序的图形界面,相比传统的LAMMPS程序,可以简化建模过程,节省时间,并自动生成模拟所需的命令,无需详...
lammps---v..LAMMPS分子动力学模拟技术与应用【录播】助力科研 助力科研 2024年12月02日 10:50 北京录播课LAMMPS分子动力学模拟技术与应用培训时间:长期招生(录播视频课程+群答疑指导+全部资料
(1)前缀v_ lammps中使用variable定义一个变量,类似与C语言中变量的定义。 如定义一个名为beta的变量: AI检测代码解析 variablebetaequaltemp/3.0 1. 要获取beta变量的值,不能直接用beta这个变量名,需要在变量名称的前面加前缀“v_": AI检测代码解析 thermo100 thermo_stylecustomstepv_beta 1. 2. (2)前缀c_...
lammps---v--pray5186 pray5186 LAMMPS分子动力学模拟技术与应用【录播】助力科研 助力科研 2024年12月02日 10:50 北京 录播课 LAMMPS分子动力学模拟技术与应用 培训时间:长期招生 (录播视频课程+群答疑指导+全部资料文件) LAMMPS是一款经典的分子动力学软件,免费开源,可以模拟液态、固态或气态的粒子的系综。目前...
(2)根据曲面方程填充原子create_atoms var v命令根据v的取值判断是否创建原子。如果v的取值为0,不创建原子,如果v的取值为非0,则创建原子。因此,如果v的取值和曲面方程联系起来,当原子的坐标位于曲面下方时创建原子,位于曲面上方时不创建原子,这样就可以生成具有特定曲面的结构。具体语法为:...
分子动力学模拟是一套数值模拟方法。该方法通过数值求解牛顿运动方程的方式,来获得系统中每个原子的位置及速度随时间的变化,从而可以获取我们所关心的物理量,如比热容、扩散系数、热导率等。简单的说,我们可以把分子动力学模拟当作在计算机上面完成的物理实验。但相比于真正的物理实验,分子动力学模拟可以获取更小空间尺度...
V(r) = q1*q2/(4πε0r) 其中,q1和q2分别为两个带电粒子的电荷量,ε0为真空介电常数,r为粒子之间的距离。在LAMMPS中,需要给定粒子的电荷量,以确定系统的相互作用。 4. Born-Mayer势参数 Born-Mayer势函数常用于描述离子晶体的相互作用,其形式如下: V(r) = A*exp(-B*r) - C/r^n 其中,A、B、...
首先,我们可以计算盒子体积:V = Lx * Ly = 100 * 100 = 10000 然后,计算每种原子类型的平均体积: 原子A的平均体积:VA = (6000 * 10000) / 6000 = 10000 原子B的平均体积:VB = (4000 * 10000) / 4000 = 10000 通过这个实例,我们可以看出LAMMPS在计算原子平均体积方面的实用性和准确性。 四、总结与...
2、variable的应用,注意 v_vPre与${vPre}的不同 3、fix ave/time语法fix ave/time命令的功能是按照设定的步数对输出变量求平均值,并将平均值保存到设定文件中。 语法规则为: fix ID group-ID ave/time Nevery Nrepeat Nfreq value1 value2 ... keyword args ... 10 5 100表示每100步计算或者保存1次...
variable L1 equal v_tmp 以上命令运行后,L1的值等于v_tmp的值,即L1=v_tmp,但此时并不计算v_tmp的值,又因为v_tmp=lx,因此L1=lx。 但此时,并没有将lx的值赋值给L1,仅仅是明确这种相等的关系。 当在下一句thermo命令输出L1的时候,再计算L1的值,根据公式L1=lx,系统计算此时lx的值,并复制给L1。