为了探究金属球的体积膨胀速率,本文的思路是:根据LAMMPS输出的dump.xyz文件确定金属球的径向密度分布曲线,根据图1所示的球形分布特点,该径向数密度分布曲线一定是先有一个平台,然后突然下降的,如图2.那么我只需要对分布曲线进行曲线拟合,并通过求导的方式找到下降区域的拐点,就可以得到球的半径r0,进而计算得到当前时刻球...
本文介绍如何使用lammps命令计算单原子的体积。 lammps提供了compute voronoi/atom命令计算单原子体积。 基本原理可参考voronoi算法,根据voronoi算法,把单个原子所占据的空间划分为一个多边形,也称为泰森多边形,多边形的体积即为该原子的体积。 命令例句: compute 1 all voronoi/atom 该例句共输出两个计算结果,第一个结果...
如原子的体积,坐标,lammps计算的能量,应力,键角这些参数。 流程如下:选择Vonoroi analysis—点左上角File—Export File—命名一个文件名(保存类型 LAMMPS Dump File)—保存—出现Data Export Settings—选择想要的参数进行输出就行了。 Data Export Settings界面 输出完如打开之前命名的文件就可以看到效果了。比如我这...
(1)导入dump文件,在Add modification选项选择“Voronoi analysis" 选择这个命令后,点击左下方的“Particles”,在原子信息列表中会自动显示每个原子的坐标、配位数、体积、半径。 (2)点击File菜单,选择“Export File”,在弹出窗口底部选择lammps dump类型的文件可导出新的dump文件。 输入文件名后,在弹出的窗口中选择新...
lammps提供了compute voronoi/atom命令计算单原子体积。 基本原理可参考voronoi算法,根据voronoi算法,把单个原子所占据的空间划分为一个多边形,也称为泰森多边形,多边形的体积即为该原子的体积。 命令例句: compute1allvoronoi/atom 1. 该例句共输出两个计算结果,第一个结果为单原子的体积,第二个结果为该原子多面体的面...
首先我们在lammps dump的文件在OVITO打开,我们可以先用color coding看一下效果,点一下Input property,Color gradient的End value可以改小一点,这样是为了看出原子体积的变化。 Color coding界面 细节注意,都在箭头指出了,也别是最后的Adjust range点一下进行调整,才可以看出改变的效果。