根据mtp的力场去跑lammps,这里需要注意的是in.my里面关于mtp3的两行 pair_style mlip load_from=curr.almtp extrapolation_control=true extrapolation_control:threshold_break=10 extrapolation_control:threshold_save=2 extrapolation_control:save_extrapolative_to=preselected.cfg pair_coeff * * 对应的就是截断,和...
1 首先把需要的包都下载下来。git clonehttps://gitlab.com/ivannovikov/interface-lammps-mlip-3.git...
mlip.ini中存放的是主动学习相关的内容,根据之前得到的grade,来挑选出一些结构,存放在preselected.cfg中,会自动读取state.als文件,来得到on the fly的主动学习状态。 MTP+lammps 上面的主动学习的可能还比较草率,参考mlip+lammps的例子,比较合适的主动学习过程可能是: 首先生成一个activate learning的状态文件。 然后...
When I run tutorial-2 (2.active_learning_md_lammps), and at configuration #90, I get the following error: Total # of neighbors = 646Ave neighs/atom = 40.375Neighbor list builds = 1403Dangerous builds = 0ERROR: Cannot reset timestep with active dump - must undump first (../output.cpp...
4. CtrkC中断已经运行Imp,然后通过cd命令进入examples目录进行 测试运 行。Microscll W'mhw、Ml*I (Cj) 201G Ml cr oso Ft Corporations 保留所有权利。C : AUs ers Cun chang'd L : PIT a gram T1.1 & s LAMMFS t 2(J 160£ 1 EM a...
在分子模拟领域,机器学习力场(ML-FFs)成功弥补了第一性原理电子结构方法与传统经验力场之间的准确性和效率差距。近年来,该领域呈现出井喷式的蓬勃发展,这一趋势在Web of Science平台的检索结果中得以印证。相关工作频繁登入Nature、Science、Cell等顶尖刊物.通过端到端的ML-FFs,构建高精度的分子力场变得轻而易举,就像...
修改Makefile.ifort文件第30行为: F90FLAGS=-O3 -xHost -ip -no-prec-div –fPIC 修改Makefile.lammps.ifort文件第4行: meam_SYSLIB=-lifcore -lsvml -liompstubs5 -limf 修改Makefile.lammps.ifort文件第5行: meam_SYSPATH= -L/opt/intel/mkl/lib/intel64/ ...
编译完之后把它复制到interface-lammps-mlip-3路径下。 cp lib_mlip_interface.a ../ 3 编译lammps 在preinstall.sh的最后可以额外添加需要的包,比如: make yes-manybody make yes-kspace make yes-molecule 执行install.sh脚本 cd .. sh ./install.sh ../mylammps intel_cpu_intelmpi ...
修改Makefile.ifort文件第30行为: F90FLAGS=-O3 -xHost -ip -no-prec-div –fPIC 修改Makefile.lammps.ifort文件第4行: meam_SYSLIB=-lifcore -lsvml -liompstubs5 -limf 修改Makefile.lammps.ifort文件第5行: meam_SYSPATH= -L/opt/intel/mkl/lib/intel64/ ...
cp lib_mlip_interface.a ../ 3 编译lammps 在preinstall.sh的最后可以额外添加需要的包,比如: make yes-manybody make yes-kspace make yes-molecule 执行install.sh脚本 cd .. sh ./install.sh ../mylammps intel_cpu_intelmpi 当然也可以根据别的需求来编译。