kSNP可以识别一组基因组序列中的全基因组SNP,并根据这些SNP估算系统发育树。 SNP发现基于k-mer分析,不需要多重序列比对或参考基因组的选择,因此kSNP可以将100多个微生物基因组作为输入。 SNP基因座由围绕中央SNP等位基因的长度为k的寡核苷酸定义。 kSNP可以分析已装配重叠群或原始,未装配读数中的完整(完成)基因组和...
在人类标准数据集（GIAB）和杂合拟南芥数据集上的实验结果显示，对比现有的单体型重建工具，KSNP具有5-10x的速度优势，其实际运行时间接近数据读入时间，表明KSNP的算法优化已经逼近速度优化的极限。KSNP是目前所有已知方案中理论时间复杂度最优的算法，实际运行时间接近线性时间复杂度，是DBG在长读长组装领域的又一成功创新...
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Here we introduce KSNP, an efficient haplotype construction tool based on the de Bruijn graph (DBG). KSNP leverages the ability of DBG in handling high-throughput erroneous reads to tackle the challenges. Compared to other notable tools in this field, KSNP achieves at least 5-fold speedup ...
荧光增白剂 KSNp用于聚酯纤维及塑料制品、聚酰胺,聚丙 烯腈等聚合物纤维的增白薄膜,注射成型和挤压成型材料等到增白、增艳;特别适用于高温尼龙塑料和工程塑胶。耐温性能优良。
KSNP型化工离心泵系立式单级双吸垂直离心泵,适应于工厂、城市、矿山、电站、农田水利工程等领域。该型泵用于输送不含固体颗粒的清水或物理、化学性质类似于水的其它液体,被输送的介质温度为0℃～80℃,允许进口压力0.6MPa左右。由于该泵立式安装,能节省泵房的投资,亦特别受农业和自来水厂的欢迎。
unzip kSNP3.1_Linux_package.zip 加入环境变量: vim ~/.bashrc i export PATH=$PATH:$HOME/tools/kSNP3.1_Linux_package/kSNP3 ESC shift + : wq! source ~/.bashrc 编辑主程序kSNP3的第8行: 将set kSNP=/usr/local/kSNP3 改为:set kSNP=/home/lhl/tools/kSNP3.1_Linux_package/kSNP3 ...
ksnp3 - Missing app & test layer What container needs an update? I know all of these containers are awesome, but... App and test layer need to be added to
KSNP-9052-1、A、E适用于医疗卫生、医药、生物、农业科研等部门作储藏菌种、生物培养进行的必备设备。 产品特点: ●微电脑智能控温仪,同时显示设定温度和箱内温度,具有因停电、死机状态、数据丢失而保护的参数记忆,来电恢复功能,具有超温、传感器故障、漏电、过流保护、声光报警功能,具有定时功能。 ●外门带有观察...
KSNP-9012-1、ASuitable for medical and health, medicine, biology, agricultural research and other departments as storage strains, biological culture necessary equipment. Product Features: ● Microcomputer intelligent temperature controller, display set temperature and temperature in the box at the same ...