KM-plotter数据库:这是一个包含5种癌症的mRNA表达谱芯片公共数据库,从中能够获得基因表达与疾病预后的信息。如果您做的是这5个癌症之一,可以考虑一下这个数据库。它的网址:http://kmplot.com/analysis/。 点开其中一个癌症的按钮,来到搜索页面: 在左上角的Affy id/Gene symbol搜索...
KM-plotter(https://kmplot.com/analysis/) 是一个在线进行生存分析的网站,数据最全并且是生存分析最权威的网站。在已发表的论文中,生存分析的数据多来自KM Plotter数据库。 网站简介 //数据库功能 可针对54,675 个基因、18,674个癌症样本展开研究,评估在21种癌症中54000个基因对生存率的影响,查看4种肿瘤的预后...
TISIDB/TIMER分析肿瘤免疫特征(机制三)。 KM plotter数据库是进行生存分析最权威的网站,数据最全,尤其在乳腺癌、卵巢癌、肺癌和胃癌,包括肝癌的研究中,具有极大的优势。尽管,象GEPIA数据库和UALCAN数据库也可以对生存率做分析,但是资料的全面性和权威性上,还稍差一些。在已发表的论文中,生存分析的数据多来自KM Plot...
3. 数据库操作演示-3KM plotter 下载积分: 1500 内容提示: 医学生做基础科研 ,发表1-3 分文章的四个套路 文档格式:PPTX | 页数:21 | 浏览次数:79 | 上传日期:2022-03-13 11:03:24 | 文档星级: 医学生做基础科研 ,发表1-3 分文章的四个套路 阅读...
1.生存分析因为生存分析是该数据库最重要的特色,我们首先分享如何通过KM plotter数据库,直接获得生存曲线。我们以FTH1基因为例,分析FTH1对肾癌存活率的影响。 首先选择Pan-cancer RNA-seq;在gene symbol位置输入基因名称,FTH1;survival有OS和RFS,随访时间最长是240个月;数据库中只有两种肾癌的亚型,KIRC和KIRP;亚型分...
作者研究了COL10A1表达和生存的关系,作者在这里利用了KM-plotter数据库和bc-gene expression miner这两个数据库进行研究。 复现步骤: 1:打开KM-plotter网站 (kmplot.com/analysis/ind)然后输入目标基因COL10A1 2:作者在文中列了OS和RFS生存状态,我们先来复现一下OS(Overall survival) 3: 根据自己课题选择ER阳性...
KM-plotter(https:///analysis/) 是一个在线进行生存分析的网站,数据最全并且是生存分析最权威的网站。在已发表的论文中,生存分析的数据多来自KM Plotter数据库。 网站简介 //数据库功能 可针对54,675 个基因、18,674个癌症样本展开研究,评估在21种癌症中54000个基因对生存率的影响,查看4种肿瘤的预后信息,包括...