Kilosort is a software package for identifying neurons and their spikes in extracellular electrophysiology, a process known as “spike sorting”. Kilosort has been primarily developed and tested on the Neuropixels 1.0 probes, but is now used on data acquired with a wide variety of ephys methods, ...
Kilosort4-Spike数据处理系列教程2: 创建一个channel map 脑极客 41 0 SPM fMRI数据处理ROI Analysis 13: 创建mask以及ROI分析 脑极客 1675 0 CONN-fMRI 静息态数据处理1:下载CONN和Demo数据 脑极客 1235 0 SPM fMRI数据处理系列教程02: 查看数据图像 脑极客 1426 0 CONN-fMRI 静息态数据处理5:降噪和数...
Cite As Marius Pachitariu (2025).Kilosort(https://github.com/cortex-lab/KiloSort), GitHub. RetrievedApril 20, 2025. MATLAB Release Compatibility Created with R2015a Compatible with any release Platform Compatibility WindowsmacOSLinux Others Also Downloaded ...
Reusing parameters from previous versions: This probably will not work well. Kilosort4 is a new algorithm, and the main parameters (the thresholds) can affect the results in a different way for your data. Please start with the default parameters and adjust from there based on what you see in...
在ZCA白化之后,kilosort还有一个整体扩大信号幅度的操作(大概是扩大200倍),这是因为kilosort为了节省内存其实是用int16而非最详细的double格式来存数据的,因为spike幅度很小,为了避免运算舍入的影响直接扩大两个数量级。 最后简单再总结一下kilosort预处理部分都干了什么:中位数去各个通道共模成分 -> 零相位滤波尽量保...
Kilosort有几大优势: 1)是运行效率非常高,基本上所有的运算部分都用GPU大规模并行运算实现; 2)引入了很多新颖的算法,比如利用神经元信号的降维压缩、卷积模版匹配检测Spike,以及通过优化专门设计的损失函数进行聚类的分析等,有很多独特的优势;...
在ZCA白化之后,kilosort还有一个整体扩大信号幅度的操作(大概是扩大200倍),这是因为kilosort为了节省内存其实是用int16而非最详细的double格式来存数据的,因为spike幅度很小,为了避免运算舍入的影响直接扩大两个数量级。 最后简单再总结一下kilosort预处理部分都干了什么:中位数去各个通道共模成分 -> 零相位滤波尽量保...
Kilosort4-Spike数据处理系列教程5: 典型神经元spike的基本特征 01:16 Kilosort4-Spike数据处理系列教程4: 基于Phy筛选神经元细胞 07:38 Kilosort4-Spike数据处理系列教程3: 基于Phy可视化Spike 08:29 Kilosort4-Spike数据处理系列教程2: 创建一个channel map 03:38 Kilosort4-Spike数据处理系列教程1: Kilosort...
Kilosort是Wanglab库中用于实现快速排序的算法。它的主要特点是使用Kilosort-Wanglib Kilosort code for Wanglab use,即在Wanglab中使用Kilosort算法进行快速排序。 Kilosort是一种基于分治思想的排序算法,它将数组分为两个部分,分别对这两部分进行排序,然后再将这两个部分合并成一个有序数组。这种方法可以有效地减少...
kilosort数据转化?目前用Intan系统进行spike信号的采集，准备用kilosort进行尖峰排序，但是不知道怎么把rhd...