1,打开绘图页面 http://www.bioinformatics.com.cn/plot_basic_pathway_enrichment_second_class_summary_bar_plot_206 2,示例数据 点击图片上方的示例数据,下载,并使用excel打开。 示例数据(仅供参考)包括两列: 第1列:富集的pathway通路名字; 第2列:映射到该通路的基因列表,以/分割 3,输入检查 Ctrl+A选中示例...
1,打开绘图页面 http://www.bioinformatics.com.cn/plot_basic_pathway_enrichment_second_class_summary_bar_plot_206 2,示例数据 点击图片上方的示例数据,下载,并使用excel打开。 示例数据(仅供参考)包括两列: 第1列:富集的pathway通路名字; 第2列:映射到该通路的基因列表,以/分割 3,输入检查 Ctrl+A选中示例...
Class III:三级分类名 Class III genes:三级分类基因 Class III gene count:三级分类基因数 Class II genes:二级分类基因 Class II gene count:二级分类基因数
Class III:三级分类名 Class III pathway genes:三级分类基因 Class III gene count:三级分类基因数 Class II pathway genes:二级分类基因 Class II gene count:二级分类基因数
http://www.bioinformatics.com.cn/plot_basic_pathway_enrichment_second_class_summary_bar_plot_206 2,示例数据 点击图片上方的示例数据,下载,并使用excel打开。 示例数据(仅供参考)包括两列: 第1列:富集的pathway通路名字; 第2列:映射到该通路的基因列表,以/分割 ...
在以“map”为前缀链接进去的页面主要包括7个模块,“名称(name)”、“通路描述(Description)”、“通路分类(Class)”、“通路图链接(Pathway map)”、“模块(Module)”、“其他数据库链接(Other DBs)”、“相关文章链接(Reference Author...
首先,使用浏览器(推荐chrome或者edge)打开KEGG Pathway二级分类汇总绘制页面。左侧为常见作图导航,中间为数据输入框和可选参数,右侧为描述和结果示例。也可以在搜索框中搜索pathway,找到绘图页面。 http://www.bioinformatics.com.cn/plot_basic_pathway_enrichment_second_class_summary_bar_plot_206 ...
紧接着,第2和第3列分别标出了KEGG A class和KEGG B class的分类信息。第4列则清晰地列出了各个Pathway的名称,点击这些名称可以直接链接到KEGG官网,查看对应的pathway map。此外,表格的第10列(Genes列)详细列出了当前通路所富集到的基因,为科研人员提供了详尽的基因信息。同时,通过查看第7列和第8列的P...
步骤一:主页面搜索框输入HIF,点击Search。步骤二:点击KEGG PATHYWAY下的map04066进入HIF-1信号通路。界面显示包括通路基本信息(Entry、Name、Description、Class),其中Description为HIF-1信号通路概述。点击Pathway map查看HIF-1信号通路图。参考文献信息包括Reference、Authors、Title、Journal。点击Related ...