直接在搜索栏里搜索KEGG通路ID与CO编号互联,点击进去即可开始使用。 http://weixin.qq.com/r/Ny7ZwaHEoPzfreWi93sl (二维码自动识别) 数据整理&参数说明 这个工具需要上传一个Excel表格(xlsx格式)的数据文件,表格内只需一列通路ID或者CO编号用于查询即可。但是注意后续的参数【查询类型】需要与表格内容对应。(...
1.打开 KEGG 数据库的网站(https://www.kegg.jp/)。 2.在网站的搜索栏中输入你要查找的微生物菌的名称或者 KEGG ID。如果你不知道微生物菌的名称,可以尝试输入其属名或者其他相关信息。 3.点击搜索按钮,系统将会显示与你输入的关键词相关的结果。
1 首先打开KEGG搜索界面，如下图。2 Search against输入"hsa"，PrimaryID 类型选择“NCBI-GeneID”，在“Enter objects one per line followed by bgcolor, fgcolor”下方文本框中输入要查询的基因名“GPX1”。3 在“Examples”下方选择“人”的通路。4 点击“Exec”，弹出查询到的通路。5 点击其中任何一个通路...
在KEGG差异代谢产物通路分析中,想要查询具体代谢通路的详细信息,可以直接访问KEGG数据库的官方网站。http://www.kegg.jp/或https://www.genome.jp/kegg/ 然后使用搜索框输入你关注的代谢通路的名称或KEGG ID。浏览搜索结果,点击你感兴趣的通路,查看详细信息,包括通路图、涉及的基因和代谢物等。
基因查询:在网站的搜索框中输入基因名、基因ID或其他相关信息,点击”Search”进行基因的搜索。KEGG提供了丰富的基因相关信息,如基因功能、通路关联等。通路查询:在网站的搜索框中输入通路名或通路ID,点击”Search”进行通路的搜索。KEGG提供了详细的代谢通路和信号传导通路信息,包括图形展示和相关基因、化合物的关联。
1、基因信息查询: 通过基因ID查询基因信息,URL格式为http://rest.kegg.jp/get/{gene_id}。例如,查询人类基因BRCA1的信息,URL为http://rest.kegg.jp/get/hsa:672。 2、化合物信息查询: 通过化合物ID查询化合物信息,URL格式为http://rest.kegg.jp/get/{compound_id}。例如,查询化合物ATP的信息,URL为http...
将entry和你想标记的基因颜色重新放在一个Excel表格中,这样方便你在通路图中清楚找到你要查询的基因,将颜色和geneID输入到KEGG Mapper中,点击Exec开始分析,可以知道哪些基因参与了哪种通路的表达调控。 根据mRNA在通路上的作用情况,以及公司反馈的与之相关的lncRNA,可以间接猜测该lncRNA也可能作用在这条通路上,之后可...
在KEGG 数据库中,研究人员可以查询目的基因的相关信息,例如基因的注释、代谢通路中的位置以及与其他基因的相互作用等。查询目的基因的方法非常简单,只需要在 KEGG 网站的搜索框中输入基因名称或者基因 ID,然后点击搜索按钮即可。搜索结果会显示在页面上,包括基因的基本信息、注释信息、代谢通路信息以及与其他基因的相互作...
首先打KEGG搜索界面图 Search against输入"hsa"PrimaryID 类型选择NCBI-GeneIDEnter objects one per line followed by bgcolor, fgcolor文本框输入要查询基名GPX1 Examples选择通路 这个可以自己找下资料 应该很好找的