## hsa04657 hsa04657 IL-17 signaling pathway 18/384 ## hsa04060 hsa04060 Cytokine-cytokine receptor interaction 34/384 ## BgRatio pvalue p.adjust qvalue ## hsa05034 187/8115 8.845476e-15 2.529806e-12 2.420867e-12 ## hsa05322 136/8115 1.113336e-13 1.592070e-11 1.523512e-11 ## hsa046...
# $ ID : chr "hsa04060" "hsa04061" "hsa05323" "hsa04668" ... # $ Description: chr "Cytokine-cytokine receptor interaction" "Viral protein interaction with cytokine and cytokine receptor" "Rheumatoid arthritis" "TNF signaling pathway" ... # $ GeneRatio : chr "46/107" "30/107" "24/...
基于KEGG通路富集分析的薏苡仁不同成分对Cytokine-cytokine receptor interaction靶基因作用,目的:探讨薏苡仁不同组分对脾虚湿阻证大鼠细胞因子-细胞因子受体相互作用的影响及关键靶点。方法:以薏苡仁不同组分作用于脾虚湿阻证大鼠,通过其肠全基因表达谱测定,对筛选的差异基
## hsa04657 hsa04657 IL-17 signaling pathway 18/384 ## hsa04060 hsa04060 Cytokine-cytokine receptor interaction 34/384 ## BgRatio pvalue p.adjust qvalue ## hsa05034 187/8115 8.845476e-15 2.529806e-12 2.420867e-12 ## hsa05322 136/8115 1.113336e-13 1.592070e-11 1.523512e-11 ## hsa046...
基于KEGG通路富集分析的薏苡仁不同成分对Cytokine-cytokine receptor interaction靶基因作用 脾虚湿阻证细胞因子-细胞因子受体相互作用薏苡仁趋化因子肿瘤坏死因子目的:探讨薏苡仁不同组分对脾虚湿阻证大鼠细胞因子-细胞因子受体相互作用的影响及关键靶点.方法:以薏苡仁不同组分作用于脾虚湿阻证大鼠,通过其肠全基因表达谱测定...
GSEA分析可以将那些GO/KEGG富集分信息中容易遗漏掉的差异表达不显著却有着重要生物学意义的基因包含在内。另外，对于时间序列数据或样品有定量属性时，GSEA的优势会更明显，不需要每个分组分别进行富集，直接对整体进行处理。数据准备,制作geneList 我们现在知道Cytokine-cytokine receptor interaction setSize ...
(Cytokinecytokine receptor interaction)通路中被显著富集;egln家族基因在HIF-1信号通路广泛表达;说明低氧应激可能诱导梭鲈鳃的先天性免疫反应,激活HIF-1,吞噬体,细胞... 吉宇丹 - 上海海洋大学 被引量: 0发表: 2023年 Integrated Analysis of Transcriptomics to Identify Hub Genes in Primary Sjgren's Syndrome ...
CCR5 (hsa:1234)属于如下哪些条pathway? (提示:搜索KEGG网站 http://www.genome.jp/kegg/) A.Cytokine-cytokine receptor interactionB.Chemokine signaling pathwayC.Wnt signaling pathwayD.p53 signaling pathway相关知识点: 试题来源: 解析 AB 反馈 收藏 ...
Now we can use ID type that is not the primary ID in KEGG database.x head(summary(x))## ID Description GeneRatio ## hsa04072 hsa04072 Phospholipase D signaling pathway 11/133 ## hsa04060 hsa04060 Cytokine-cytokine receptor interaction 14/133 ## hsa04390 hsa04390 Hippo signaling pathway ...
qvalueCutoff=0.1,readable=TRUE) head(summary(kk)) > head(summary(kk)) ID Description GeneRatio BgRatio hsa04110 hsa04110 Cell cycle 31/247 124/6861 hsa03030 hsa03030 DNA replication 9/247 36/6861 hsa04060 hsa04060 Cytokine-cytokine receptor interaction 25/247 265/6861 ...