KEGG Automatic Annotation Server,KEGG数据库的自动注释服务简称KAAS。在线网址为:http://www.genome.jp/tools/kaas/,其首页页面见图1。 那当我们拿到目标蛋白时如何进行KEGG的自动注释呢? ▼▼▼ 1. 进入KEGG中自动注释工具界面,KAAS(http://www.genome.jp/tools/kaas/),如图1, 图1 KAAS首页 2. 跳转到KAAS...
Pathview是一个用于整合表达谱数据并用于可视化KEGG通路的一个R包,其会先下载KEGG官网上的通路图,然后整合输入数据对通路图进行再次渲染,从而对KEGG通路图进行一定程度上的个性化处理,并且丰富其信息展示。(KEGG在线数据库使用攻略) Pathview的安装 一种方法是通过Bioconductor安装,需要Bioconductor版本3.9,R的版本3.6 (推荐...