做转录组测序,将筛选出来的差异表达基因进行KEGG分析,结果所有的pathway的q value都大于0. 05,甚至是...
GeneRAatio:富集到该通路里的差异基因数/全部可以富集到KEGG里的差异基因数,BgRatio:该通路的全部基因数/该物种全部有KEGG信息的基因数,pvalue是p值,p.adjust表示矫校正过的p值,qvalue是q值,geneID表示富集到该通路里的基因的名称,Count表示富集到该通路中的差异基因的数目。
非配对limma差异分析,我们可以看到差异分析之后,adj.P小于0.05的有6793个(allDiff=topTable(fit2,adjust='fdr',coef=2,number=Inf, p.value=0.05)#把,此处的P是adj.P,p.value=0.05删掉就是所有的分析结果): 第五步、使用limma...
做转录组测序,将筛选出来的差异表达基因进行KEGG分析,结果所有的pathway的q value都大于0. 05,甚至是...
做转录组测序,将筛选出来的差异表达基因进行KEGG分析,结果所有的pathway的q value都大于0. 05,甚至是...