在KEGG 富集分析中，一般建议查看矫正后的 p 值（如FDR等），而不是未经过矫正的原始 p 值。因为在...
在进行蛋白质KEGG通路注释和富集分析时,您可以根据两种主要的标准来选择列出的通路: 1.基于P值的选择: 这是最常用的方法。在这种情况下,您可以根据统计显著性(通常是P值)来选择通路。P值较小的通路通常被认为在统计上更显著,意味着您的数据集与这些通路有更强的相关性。选择P值低于特定阈值(例如0.05或0.01)的...
KEGG是系统地分析基因功能、链接基因组信息和功能信息的数据库。通过对生物学过程进行计算机处理，构建模块...
FDR表示的是信度,而不是富集程度或P值的大小.一般来说,FDR越小,表示该通路的富集结果越可靠.在KEGG通路分析中,你应该关注那些FDR值较小的通路,因为它们更可能是真正与你的研究相关的通路.
在进行GO和KEGG富集分析时，阈值和P值的设定并不是反向设置。阈值用于筛选显著富集的功能和通路，而P值...
如果使用校正后的p值，阈值可以适当放宽一点，尤其是富集到了感兴趣的通路而且排序还很靠前。除了p值...
KEGG是系统地分析基因功能、链接基因组信息和功能信息的数据库。通过对生物学过程进行计算机处理，构建模块...