蛋白质组学是一门研究蛋白质质量、结构和功能的综合学科.主要目标是鉴定和定量一个特定条件下细胞中的所有蛋白质,以及研究这些蛋白质之间的相互作用.在这个过程中,KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) 分析被广泛应用.
KEGG数据库的网址是:https://www.kegg.jp/。 本期介绍KEGG数据库的核心模块KEGG Pathway在网络药理学研究中的应用。其网址是: https://www.kegg.jp/kegg/pathway.html 一、数据库的主要内容 在KEGG Pathway的主页上,按以下7大类列出了该数据库包含的所有通路: 1. Metabolism 2. Genetic Information Processing ...
了解KEGG分析的步骤和应用,包括数据预处理、富集分析、通路分析、网络分析和功能注释.通过对基因集进行富集分析和通路分析,可以揭示基因在生物过程中的作用和调控关系.网络分析和功能注释有助于理解基因之间的相互作用和功能.掌握KEGG分析的方法可以帮助我们深入研究复杂疾
KEGG是一个集成数据库资源,包括生物化学途径、疾病信息、药物信息、化学物质和基因组数据。KEGG主要用于理解生物系统的高级功能和实用性,以及生物化学物质的转化。 分析原理 KEGG分析通常关注于代谢途径、信号传导途径等生物途径的富集分析。主要步骤包括: - 途径注释:将感兴趣的基因集映射到KEGG途径。 - 富集分析:检查...
DAVID是一款在线免费分析软件，主要用于Gene ID转换，差异基因的功能和通路富集分析，本经验主要就Gene的GO和KEGG富集分析进行讲解分析。工具/原料 DAVID网址：https://david-d.ncifcrf.gov/ Gene名称必须是office gene symbol 方法/步骤 1 在这里我们选取CGC中的gene作为演示，这里Gene以列表形式出现（如下图所示）...
应用KEGG进行跨物种转录组比较的生物信息方法 生物信息KEGG转录组基因组跨物种基因表达本文简单的介绍了一个应用KEGG进行跨物种转录组比较的生物信息方法陈作舟黑龙江科技信息
KEGG数据库应用.pdf 生物技术通报 ·技术与方法· BIoTECHNOLOGYBULLETIN 2011年第1期 KEGG数据库在生物合成研究中的应用 韩增叶 田平芳 (北京化工大学生命科学与技术学院,北京100029) 摘要: ofGenesand KEGG(KyotoEncyclopedia (BRITE)。KEGG还为各种组学研究提供相关软件。用于代谢途径重建、遗传分析和化合物比对。作为...
KEGG数据库使用教程全解 自“一抹新绿的博客”转载KEGG中的pathway是根据相关知识手绘的,这里的手绘的意思可能是指人工以特定的语 言格式来确定通路各组件的联系;基因组信息主要是从 NCBI等数据库中得到的,除了有完整的基因序列外,还有 没完成的草图;另外 ...
摘要: 随着生物信息学的飞速发展,与之相应的各种类型的数据库不断涌现,KEGG数据库便是其中之一.本文详细介绍了KEGG数据库的主要内容及其功能,并以运用该数据库Mat Inspector V2.2软件预测NGAL基因5'端转录调控区增强子元件为例说明了KEGG数据库在基因转录调控研究中的应用.关键词:...
华为云帮助中心为你分享云计算行业信息,包含产品介绍、用户指南、开发指南、最佳实践和常见问题等文档,方便快速查找定位问题与能力成长,并提供相关资料和解决方案。本页面关键词:kegg富集分析。