1.打开Kaplan-Meier Plotter网站https://kmplot.com/analysis/ TP53是编码基因,因此我们应该选择mRNA。可以发现第一行是基于mRNA的基因芯片数据进行生存分析,但只有乳腺癌、卵巢癌、肺癌和胃癌可选;第二行是基于mRNA的RNA测序数据进行生存分析,其中乳腺癌和肝...
Kaplan-Meier Plotter(http://kmplot.com/analysis/index.php?p=background)是常用的进行生存分析的网站,其数据来源于GEO、EGA、TCGA数据库,能够评估来自21种肿瘤的30000多个样本中所有基因的表达与患者生存率之间的相关性,从而发现和验证与生存相关的生物标志物。 下面就以探究基因TP53的表达与肝癌患者生存率的关系为...
Kaplan-Meier Plotter(http://kmplot.com/analysis/index.php?p=background)是常用的进行生存分析的网站,其数据来源于GEO、EGA、TCGA数据库,能够评估来自21种肿瘤的30000多个样本中所有基因的表达与患者生存率之间的相关性,从而发现和验证与生存相关的生物标志物。 下面就以探究基因TP53的表达与肝癌患者生存率的关系为...
第一款:Kaplan-Meier Plotter数据库 ★★★☆ Kaplan-Meier Plotter数据库这是今天推荐首款生存曲线制作方法,官网(http://kmplot.com/analysis/),它是长的这个样子的。 乍一看,Kaplan-MeierPlotter数据库似乎只能研究6个癌种,小编之前也犯了同样的错误,“pan-cancer”(pancreatic cancer,胰腺癌像不像?)。其实,“...
1.首先打开Kaplan Meier plotter地址(http://kmplot.com/analysis/)2.然后输入LAYN基因,Survival一栏选择根据条件可以选择OS、RFS、DMFS或PPS等生存因素3.点击draw Kaplan Meier plot生成图片4.得到含有HR和logrank P值的结果图:今天的分享就到这里啦,希望能帮到苦心科研的你,我们下次再见!上...
首先，访问Kaplan-Meier Plotter网站（http://kmplot.com/analysis/index.php?p=background），在肿瘤选择部分，找到“liver cancer”模块，以肝癌为研究对象。根据需要，选择mRNA数据进行生存分析，注意模块间的差异以适应具体研究需求。在网站中输入目标基因TP53，调整设置后点击“Draw Kaplan-Meier plot”...
Kaplan-Meier Plotter Recent updates 2024.11.06.:A bug in the trichotomization process was corrected. 2024.11.01.:The "Restart" button in the custom plot page now returns to the previously uploaded data table. 2024.10.29.:The custom plot page now displays the time unit correctly in the plot...
KM-plotter可以评估基因表达与生存之间的相关性 二、Kaplan-meier Plotter数据库使用页面介绍 输入网址http://kmplot.com/analysis/,进入Kaplan-meimer Plotter数据库主页面。页面中央几个颜色的方块分别对应了mRNA,miRNA,protein以及DNA等四种分子的检索入口,其中mRNA分为gene chip数据以及RNA-seq数据。前者包括乳腺癌、...
The KM plotter is capable to assess the effect of any gene or gene combination on survival in breast, ovarian, lung, gastric, colon, prostate, GBM, LGG, melanoma, DLBCL, RCC, AML, and 14 other tumor types using over 50,000 samples measured using gene arrays, RNA-seq or next generation...
使用网址为:http://kmplot.com/analysis/ 进入该网站的首页,可以看到强大的Kaplan Meier plotter网站,能够评估5.4万个基因在21种癌症类型中的作用,其中有4种癌症数据比较齐全,分别为乳腺癌、卵巢癌、肺癌和胃癌。 下面具体讲解怎样使用该数据库。 操作步骤: ...