一、数据库简介Kaplan-MeierPlotter(http://kmplot.com/analysis/index.php?p=background)是常用的进行生存分析的网站,其数据来源于GEO、EGA、TCGA数据库,可针对54,675 个基因、18,674个癌症样本展开研究,评估在21种癌症中54000个基因对生存率的影响,查看...
在分析某一特定基因的预后价值时,Kaplan-meier Plotter数据库以该基因表达量的不同分位数为标准将患者分为两组,通过Kaplan-meimer生存图对两个队列进行比较并计算出HR,95%CI以及logrank P值。目前数据库对于mRNA水平的研究证据最为充分,miRNA、DNA以及蛋白水平的研究也在飞速发展,这些分子在Kaplan-meier Plotter数据...
零基础学习生存分析,Kaplan-Meier Plotter数据库是适合初学者的工具,其数据来源广泛,能评估基因与患者生存率的相关性,用于发现生物标志物。接下来,我们将通过探究TP53基因在肝癌患者中的表达与生存率关系,演示如何使用Kaplan-Meier Plotter进行生存分析。首先,访问Kaplan-Meier Plotter网站(http://kmplot...
使用网址为:http://kmplot.com/analysis/ 进入该网站的首页,可以看到强大的Kaplan Meier plotter网站,能够评估5.4万个基因在21种癌症类型中的作用,其中有4种癌症数据比较齐全,分别为乳腺癌、卵巢癌、肺癌和胃癌。 下面具体讲解怎样使用该数据库。 操作步骤: 点击start KM plot for breast cancer,进入乳腺癌生存分析...
Kaplan Meier plotter能够评估54k基因(mRNA,miRNA,蛋白质)对21种癌症类型(包括乳腺癌(n = 6,234),卵巢癌(n = 2,190),肺癌(n = 3,452)和胃癌)的存活率的影响 (n = 1,440)。Kaplan Meier plotter 数据库的来源包括GEO,EGA和TCGA。 该工具的主要目的是基于荟萃分析的生存生物标记物的发现和验证。
Our aim was to develop an online Kaplan-Meier plotter which can be used to assess the effect of the genes on breast cancer prognosis.
Kaplan-Meier Plotter数据库是一个恶性肿瘤预后相关的在线分析数据库,可以评估54000多个基因表达对21种癌症类型预后的影响.在医学教学及科研中,可应用此数据库探索目标基因表达同相关肿瘤预后的关系,应用方便、高效.非小细胞肺癌(non-smal cel lung cancer,NSCLC)治疗已进入精准治疗时代,根据驱动基因突变或扩增情...
Our aim was to develop an online Kaplan-Meier plotter which can be used to assess the effect of the genes on breast cancer prognosis.
Kaplan-Meier PlotterPan-cancer RNA-seqTerms of use Updates Download Upload Home KM plotterPlot options Gene symbol: Use multiple genes Split patients by Auto select best cutoff Trichotomization Survival: Compute median survival: Follow up threshold: Censore at threshold: Select all (n=...