1.打开Kaplan-Meier Plotter网站https://kmplot.com/analysis/ TP53是编码基因,因此我们应该选择mRNA。可以发现第一行是基于mRNA的基因芯片数据进行生存分析,但只有乳腺癌、卵巢癌、肺癌和胃癌可选;第二行是基于mRNA的RNA测序数据进行生存分析,其中乳腺癌和肝...
1.首先打开Kaplan Meier plotter地址(http://kmplot.com/analysis/) 2.然后输入LAYN基因,Survival一栏选择根据条件可以选择OS、RFS、DMFS或PPS等生存因素 3.点击draw Kaplan Meier plot生成图片 4.得到含有HR和logrank P值的结果图: 今天的分享就到这里啦,希望能帮到苦心科研的你,我们下次再见!
首先,访问Kaplan-Meier Plotter网站(http://kmplot.com/analysis/index.php?p=background),在肿瘤选择部分,找到“liver cancer”模块,以肝癌为研究对象。根据需要,选择mRNA数据进行生存分析,注意模块间的差异以适应具体研究需求。在网站中输入目标基因TP53,调整设置后点击“Draw Kaplan-Meier plot”...
Kaplan-Meier PlotterBreast cancerTerms of use Updates Download Upload Home KM plotterPlot options 1. Select gene symbol/Uniprot ID: 2. Select dataset: Liu_2014 (n=126) TCGA-RPPA (n=873) DeMarchi_2015 (n=112) Tang_2018 (n=118) Survival options Survival Split patients by Auto ...
KM-plotter可以评估基因表达与生存之间的相关性二、Kaplan-meierPlotter数据库使用页面介绍输入网址/analysis/,进入Kaplan-meimerPlotter数据库主页面。页面中央几个颜色的方块分别对应了mRNA,miRNA,protein以及DNA等四种分子的检索入口,其中mRNA分为genechip数据以及RNA-seq数据。前者包括乳腺癌、卵巢癌、肺癌以及胃癌的数据;...
Our aim was to develop an online Kaplan-Meier plotter which can be used to assess the effect of the genes on breast cancer prognosis.
Kaplan-Meier Plotter数据库是一个恶性肿瘤预后相关的在线分析数据库,可以评估54000多个基因表达对21种癌症类型预后的影响.在医学教学及科研中,可应用此数据库探索目标基因表达同相关肿瘤预后的关系,应用方便,高效.非小细胞肺癌(non-smal cel lung cancer,NSCLC)治疗已进入精准治疗时代,根据驱动基因突变或扩增情况选择相应...
目的:探讨蛋白酶活化受体(PARs)家族成员在胃癌中的表达状态对患者生存结局的影响.方法:基于基因表达谱交互分析(GEPIA)数据库分析PARs成员信使核糖核酸(mRNA)在胃癌组织中的表达水平,并借助Kaplan–Meier Plotter在线工具分析PAR1~4表达对患者总生存期(OS),进展生存期(FP)及复发后生存期(PPS)的影响.结果:GEPIA收录数据...
方法收集Oncomie和Kaplan-Meier Plotter数据库中关于KLF5基因表达的相关数据集,深入挖掘KLF5基因在GC组织与正常胃组织中的差异表达情况,根据KLF5中位表达水平分为高表达组和低表达组,绘制生存曲线并用Log-rank检验比较KLF5高、低表达组患者总生存及无疾病进展生存是否存在差异.同时回顾性分析天津市宝坻区人民医院收治并...
In this study, we presented a new Kaplan-Meier plotter model with a better-combination of input features for early prognosis tasks of pancreatic cancer. Our new model integrates gender, race, and follow up the threshold to get better verification of genes of interest as prognostic markers for ...