换句话说,CDR-L1和CDR-H1中晶体结构中的相应残基(拓扑排列)在Kabat编号方案中不共享相同的编号。 图1 | CDRL1氨基酸插入位置根据Kabat和Chothia编号方案,用于蛋白质数据库(PDB)结构1igm和2imm的轻链可变结构域。 (A)根据Kabat或Chothia编号方案的1igm和2imm CDR1L的氨基酸序列。根据Kabat的编号,从较长的环中插入...
Kabat Numbering应该是在Eu Numbering的基础上结合更多的Ig序列进行了改善后的编号系统,也是迄今仍广为使用的抗体序列编号系统。 现在有几套抗体编号系统在并行使用,经典的Kabat,Chothia编号,IMGT编号;还有一些使用面较小的编号系统。 各编号系统的对比:http://www.imgt.org/IMGTScientificChart/#B 下图对比了抗体C do...
然而,与Kabat或IMGT编号方案(见下文)相比,这种编号方案的使用有限,也会产生混淆。该编号方案的一个重要限制:是由于使用最常见的CDR序列长度,如Kabat编号方案,因此Chothia方案忽略了具有非常规长度的序列。然而,类似于Kabat编号方案,可以通过定义新的插入点来优化该系统。 3、IMGT编号方案 1997年,Lefranc等人为免疫球蛋白...
Kabat Numbering应该是在Eu Numbering的基础上结合更多的Ig序列进行了改善后的编号系统,也是迄今仍广为使用的抗体序列编号系统。 现在有几套抗体编号系统在并行使用,经典的Kabat,Chothia编号,IMGT编号;还有一些使用面较小的编号系统。 各编号系统的对比:http://www./IMGTScientificChart/#B 下图对比了抗体C domain的IMG...