点击External links选项卡下的外部数据库图标,可以链接到外部数据库相应转录因子(蛋白)的信息页面,比如点击UniPort数据库的图标,可以查看该转录因子的详细注释信息,如下。 2.得到已知转录因子的详细信息 点击搜索,在搜索框内查找关注的转录因子信息,可以检索转录因子名称,物种信息,转录因子ID,Uniprot ID ,或者其他关注信息。
5.预测靶基因启动子区域可能的转录因子 总结来说，JASPAR数据库是一个强大的工具，可以帮助研究人员查找转录因子的详细信息，预测靶基因的转录因子结合位点，对于组学数据分析中的靶基因研究非常有帮助。
点击External links选项卡下的外部数据库图标,可以链接到外部数据库相应转录因子(蛋白)的信息页面,比如点击UniPort数据库的图标,可以查看该转录因子的详细注释信息,如下。 2.得到已知转录因子的详细信息 点击搜索,在搜索框内查找关注的转录因子信息,可以检索转录因子名称,物种信息,转录因子ID,Uniprot ID ,或者其他关注信息。
TFs可根据其DBD分为结构相关的家族。具有相同结构家族DBD的TF往往能识别相似的 DNA 序列基序。转录因子已经成为生物学和医学研究中的热点,我们可以通过寻找已知转录因子的靶基因来确定转录因子的调控功能。今天为大家分享1个网站,可以用于预测动物、植物、真菌等转录因子的结合位点motif信息——JASPAR数据库。
总结来说,JASPAR可以查找转录因子的详细信息,也可以预测靶基因的转录因子结合位点。对于组学数据分析中找到目标靶基因又想去找转录因子的,这个数据库是一个非常好的方案。 参考文献: Fornes O , Castro-Mondragon J A , Khan A ,et al.JASPAR 2020: update of the open-access database of transcription factor...
TFs可根据其DBD分为结构相关的家族。具有相同结构家族DBD的TF往往能识别相似的 DNA 序列基序。转录因子已经成为生物学和医学研究中的热点,我们可以通过寻找已知转录因子的靶基因来确定转录因子的调控功能。今天为大家分享1个网站,可以用于预测动物、植物、真菌等转录因子的结合位点motif信息——JASPAR数据库。
点击External links选项卡下的外部数据库图标,可以链接到外部数据库相应转录因子(蛋白)的信息页面,比如点击UniPort数据库的图标,可以查看该转录因子的详细注释信息,如下。 2.得到已知转录因子的详细信息 点击搜索,在搜索框内查找关注的转录因子信息,可以检索转录因子名称,物种信息,转录因子ID,Uniprot ID ,或者其他关注信息。