ITS2 Database9 Department of Bioinformatics, University of Würzburg Website: http://its2.bioapps.biozentrum.uni-wuerzburg.de Software: 4SALE15,16 Department of Bioinformatics, University of Würzburg Download: http://4sale.bioapps.biozentrum.uni-wuerzburg.de/ Software: ProfDistS17 Department of...
ITS2 Database9 Department of Bioinformatics, University of Würzburg Website: http://its2.bioapps.biozentrum.uni-wuerzburg.de Software: 4SALE15,16 Department of Bioinformatics, University of Würzburg Download: http://4sale.bioapps.biozentrum.uni-wuerzburg.de/ Software: ProfDistS17 Department of...
并用The ITS2 Database在线软件预测二级结构.结果:ITS2序列可将17种植物互相区分开并聚为7类,其中红豆蔻与阳春砂,土田七与红球姜,美人蕉与菠萝姜这3组不同属... 钟志敏,赖小平,黄松,... - 《中药材》 被引量: 1发表: 2017年 ITS2 序列作为 DNA 条形码鉴定几种虎耳 草科植物的有效性研究 Predicting an...
Moreover, the secondary structure of ITS2 was predicted using ITS2 database websites. Results The intra-specific genetic distances were smaller than inter-specific ones in ITS2 regions of B. marginatum var. stenophyllum. The NJ tree and secondary structure results could distinctly differentiate B...
基因序列下载自GenBank并通过其基因注释信息结合ITS2 Database的Annotate功能界定ITS2。 在常规系统发育分析中,选用贝叶斯方法构建基于DNA模型的系统发育树,使用MrModelTest获得最优进化模型,使用MrBayes软件构建贝叶斯树。在基于RNA进化模型的系统发育分析中,首先使用LocARNA软件来预测ITS2共有二级结构,并根据ITS2的保守...
本研究还使用了LocARNA二级结构比对功能,利用软件Mfold[41]或网站ITS2 database二级结构预测在线服务器(http://its2-old.bioapps.biozentrum.uni-wuerzburg.de/cgi-bin/index.pl?custom)将核酸序列折叠成二级结构后,再将核酸序列和二级结构联合矩阵输入到LocARNA进行二级结构比对。比较3种方法获得的二级结构模型,筛选...
摘要 本发明公开了一种DNA水平快速鉴定地肤子与其混伪品的方法,包括如下步骤:1)提取样品地肤子DNA;2)以待测样品DNA为模板,PCR扩增ITS2序列的片段;3)将PCR产物正向测序,经过ITS2database剪切获得地肤子ITS2序列;4)进行NJ系统发育树构建、种内及种间平均遗传距离分析、二级结构特征比较。结果表明地肤子ITS2序列聚类成...
The ITS2 Database III—sequences and structures for phylogeny 远志及其近缘种的ITS序列分析及鉴定 基于DNA条形码ITS2序列对阿魏属药用植物的鉴别研究Δ 基于ITS序列的紫芝分子鉴定 基于ITS2条形码的中药材威灵仙与其易混伪品的鉴定 滇金丝猴毛首线虫分子鉴定及其ITS序列分析 ITS序列分析在真菌分类鉴定中的应用 rDNA...
[16] Koetschan C,F rster F,Keller A,Schleicher T,Ruderisch B,Schwarz R,Müller T,Wolf M,Schultz J.The ITS2 Database III-sequences and structures for phylogeny[J].Nucleic Acids Research,2010,38(suppl 1):275-279. [17] Gao T,Yao H,Song J Y,Liu C,Zhu Y J,Ma X Y,Pang X H...
基于ＩＴＳ２序列的藏当归及易混植物ＤＮＡ分子鉴定 姜 钊１，色里玛２，李 捷１，陈依春１，郝婷婷１，孙芳云１ （１．西藏民族大学藏药检测技术教育部工程研究中心，陕西咸阳７１２０８２；２．西藏甘露藏药股份有限公司，西藏拉萨８５１４００） 摘要：笔者所在实验室长期从事藏药基源鉴定与药物开发，为了确保...