dcm2niix这个工具反而能发现这种情况,生成了两个相同的nii文件。不得不说,dcm2niix的转换能力是比较强的。
一、.nii文件的查看 主要介绍两种方式,一种是直接用软件打开,另一种是用python代码打开并查看,前者可以从各个视角进行查看,后者的灵活性更好。 1.ITK-SNAP软件ITK-SNAP软件的下载地址为:下载地址安装之后在打开 .nii 格式的文件时直接选择该软件即可,如上图所示...
source=directory使用方法 首先,ITK-SNAP只能导入医学图像相关格式,例如Dicom、.nii等格式,在导入CT图像时,在一个目录下即使导入一个断层文件,该软件也会... Toolbar中选择工具进行标注,沿着3个轴位进行,逐层标注完成后点击左下角视窗的update更新视图,就可以看到标注好的3D图像。 导入分割结果。当我们有已标注的...
1、导入医学图像( nii.gz文件) File->Open Main Image 点击Browse... (切记不能有中文路径) -> Next 2、载入相应的分割图数据( nii.gz文件) Segmentation - > Open Segmentation -> Browse... -> Next 3、3D可视化 左键可以选装3D图像 右键加滚轮可以缩放3D图像 4、导出不同切面的2D图像...
您好！要直接打开分割图像进行3D重建，可以按照以下步骤操作：1. 在ITK-SNAP+中打开分割图像（.nii、.nii.gz、.hdr、.img等格式），可通过点击“File”->“Open Image”来实现。2. 在左侧工具栏中选择“3D视图”，可以看到3D重建的效果。3. 若需要进行进一步的3D重建操作，可以在左侧工具栏中选择“...
点击右下方“Open Image”可以打开Dicom或nii格式的影像文件,也可以直接将文件拖拽到黑色区域,直接打开 载入文件后,进入工作界面,左侧是功能区,右侧视窗 视窗分为轴(A)、矢(S)、冠(C)和3D视窗,视窗内有同步定位十字线,鼠标滚轮可以翻页 功能区主要分为:主要工具、标签操作区 ...
img2 = nib.load(nii_file2).get_fdata()#两幅图像相乘img3 = np.multiply(img,img2)#将矩阵转换为niiarray_img = nib.Nifti1Image(img3,None)#保存并导出nib.save(array_img,'reg_IR'+'_'+index[i]+'.nii')print('img'+index[i]+'Done') ...
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存放原始的 nii 格式的文件。此文件夹下面的子文件夹,即第二级目录,对序列进行分类命名(不能出现空格),t1w, t2w,dwi……等等,大小写均可;第三级目录,即每个序列下面,对 subject 进行编号,sub001,sub002, sub003……等等;如果数据超过 999 例,则统一用四位数进行编号,sub0001, sub0002, sub0003……等。(...
nib.save(array_img,'reg_IR'+'_'+index[i]+'.nii')print('img'+index[i]+'Done') 对于一般格式图像利用numpy中的img = np.multiply(img1,img2)进行两幅图像的点乘即可。 以上这篇使用ITK-SNAP进行抠图操作并保存mask的实例就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考。