由客户提供IP实验获得的beads样品→谱度众合以高分辨液质联用系统进行检测→基于质谱检测数据出具检测和分析报告,报告内容包括:IP-MS实验效果和数据质量评估结果、高可信度互作蛋白列表和可用于辅助筛选关键互作蛋白的注释富集分析、蛋白互作数据库挖掘、互作网络分析、筛选和互作网络构建、结合公开蛋白互作数据库挖掘信息筛选...
SIANT算法最近的更新版本中(SAINTq),也改用基于信号强度的定量值进行蛋白评分和互作蛋白筛选了。 因此在目前的IP-MS数据分析中,主要以蛋白的非标记定量信号强度(LFQ intensity)作为蛋白定量数据,比较实验组与对照组间蛋白定量差异,与常规定量蛋白质组学数据分析方法类似,只是通常选择更高的差异蛋白筛选阈值。 3、数据...
混合体系中能与目的蛋白相互作用的蛋白质通过特异性结合而与其他蛋白组分分离开来,通过蛋白纯化,获得与目的蛋白质相互作用的靶蛋白。 最后通过液相色谱串联质谱技术可以对酶解后的肽段进行质谱分析,从而分析与目的蛋白相互作用的未知蛋白。IP-MS不仅可以用于验证已知的相互作用的蛋白,还可以用于寻找能与目的蛋白相互作用的...
SIANT算法最近的更新版本中(SAINTq),也改用基于信号强度的定量值进行蛋白评分和互作蛋白筛选了。 因此在目前的IP-MS数据分析中,主要以蛋白的非标记定量信号强度(LFQ intensity)作为蛋白定量数据,比较实验组与对照组间蛋白定量差异,与常规定量蛋白质组学数据分析方法类似,只是通常选择更高的差异蛋白筛选阈值。 3、数据...
免疫沉淀结合质谱分析(IP-MS)原理介绍: 蛋白质相互作用(Protein-Protein Interactions,PPIs)和翻译后修饰( Post-Translational Modifications,PTMs)的数据是能显著提高基础类研究文章档次的重要内容。 IP-MS,即免疫沉淀(IP ,Immunoprecipitation)结合LC-MS(液相色谱-质谱联用,蛋白质组学研究的核心工具),是筛选和发现目的...
1. IP-MS分析的原理 免疫沉淀-质谱(IP-MS)分析是将特异性抗体用于选择性地捕获目标蛋白质及其相互作用的蛋白质，随后利用质谱技术对这些蛋白质进行鉴定和定量分析的方法。在IP步骤中，我们使用抗体与目标蛋白质结合，从复杂的细胞提取物中高效地将目标蛋白质及其相互作用的蛋白质捕获下来。然后，将这些蛋白质通过质谱...
1. IP-MS分析的原理 免疫沉淀-质谱(IP-MS)分析是将特异性抗体用于选择性地捕获目标蛋白质及其相互作用的蛋白质,随后利用质谱技术对这些蛋白质进行鉴定和定量分析的方法。在IP步骤中,我们使用抗体与目标蛋白质结合,从复杂的细胞提取物中高效地将目标蛋白质及其相互作用的蛋白质捕获下来。然后,将这些蛋白质通过质谱技术...
IP-MS(免疫共沉淀质谱分析)和Co-IP MS(共免疫共沉淀质谱分析)都是研究蛋白质相互作用的技术,主要区别在于目标蛋白质的选择和识别过程: 1.IP-MS: 先通过特异性抗体与目标蛋白质结合,形成抗体-蛋白质复合物,然后通过沉淀这些复合物,再利用质谱技术对沉淀物中的蛋白质进行鉴定。这种方法主要用于鉴定一个已知目标蛋白...
IP-MS结合了免疫沉淀(Immunoprecipitation)和质谱技术,通过将待测蛋白质与特定抗体结合,然后用质谱仪对免疫沉淀后的样品进行分析,从而获得蛋白质的定量和定性信息。 2. IP-MS IP-MS的原理主要包括样品制备、免疫沉淀、蛋白质消化和质谱分析四个关键步骤。 2.1 在进行IP-MS之前,需要对样品进行处理。首先,将待测蛋白...
IP-MS原理分为三个主要步骤:免疫沉淀、核心质谱分析和数据分析。 首先是免疫沉淀。实验开始时,科学家会使用抗体与感兴趣的蛋白结合。这些抗体可以是单克隆抗体或多克隆抗体,具体选择由实际需要决定。然后,这些抗体会与一些介质(如磁珠或琼脂糖)结合,以便后续的分离和富集。此时,生物样本中的目标蛋白也会结合在这些抗体...