关于IMGT数据库 在HGM(人类基因组图谱)的赞助下,IMGT(国际免疫遗传学数据库)于1989年6月在蒙彼利埃(蒙彼利埃大学和CNRS)成立。IMGT的诞生标志着免疫遗传学和生物信息学的交叉学科免疫信息学的诞生。 蒙彼利埃市(Montpellier)位于法国南部地中海畔,北距巴黎746公里。是法兰西共和国埃罗省省会,郎格多克地区
IMGT/HLA数据库简介 数据库收录了HLA不同Allel 的序列信息,网址如下 https://www.ebi.ac.uk/ipd/imgt/hla/ 最近更新日期为2018年7月11号,版本为3.33.0, 数据库中收录的信息如下 1. 数据概览 数据库中主要收录了HLA I 型和II 型基因的Allel信息,此外,还包含了一些非HLA基因的Allel 2. HLA I 型 对于HLA...
以下是使用imgt数据库的一般步骤: 访问imgt数据库:您可以在互联网上访问imgt数据库,通常是通过imgt的官方网站。在网站上,您可以浏览各种基因和蛋白质序列信息,并使用各种搜索和筛选工具来查找您感兴趣的序列。 搜索序列:imgt数据库提供了多种搜索工具,如关键词搜索、序列相似性搜索等。您可以使用这些工具来查找您感...
进入:http://www.imgt.org/IMGTrepertoire/LocusGenes/#F 可以看到,并不是所有的物种的免疫相关基因,都被IMGT数据库收录 首先看IG相关的V,D,J和C基因记录情况: 同理,可以看TR的V,D,J和C基因记录情况 如果大家要做免疫组库,最好是有IMGT提供你研究的物种的相关新,后续数据分析会简单很多。 查看相应V,D,J...
在IMGT数据库的V,D,J和C基因记录情况 进入:imgt.org/IMGTrepertoire 可以看到,并不是所有的物种的免疫相关基因,都被IMGT数据库收录 首先看IG相关的V,D,J和C基因记录情况: 同理,可以看TR的V,D,J和C基因记录情况 如果大家要做免疫组库,最好是有IMGT提供你研究的物种的相关新,后续数据分析会简单很多。 查看...
1.2 IMGT的主要功能 IMGT数据库的主要功能包括: 基因和蛋白质序列的标准化命名:IMGT为免疫系统相关基因和蛋白质提供了一套标准化的命名规则,确保不同研究之间的数据可以相互比较和整合。 序列分析和注释:IMGT提供了详细的序列分析和注释工具,帮助研究人员理解基因和蛋白质的结构、功能和进化关系。
IPD-IMGT/HLA 数据库(https://www.ebi.ac.uk/ipd/imgt/hla/)首次公开发表于1998年12月16日 ,包含 WHO HLA 命名委员会正式命名的全部HLA等位基因的记录。这些记录来自 EMBL/GenBank/DDBJ 原始记录中专家注释的拷贝。 截至2019年8...
利用IMGT数据库，研究者可以访问大量免疫相关基因记录，包括V、D、J和C基因，以及不同物种的特定基因数量。这些信息对于免疫组库研究至关重要，尤其在没有IMGT提供特定物种资源的情况下，后续分析可能会更为复杂。免疫组库测序技术为理解免疫应答机制提供了强大工具，通过对淋巴细胞受体多样性进行量化，研究者...
前面我在生信技能树的推文教程:通过IMGT数据库认知免疫组库 提到了它是目前免疫组库相关fasta序列整理的最齐全的。 BCR有IGH,IGK,IGL这3类,而TCR有TRA,TRB,TRD,TRG,它们各自都有V,D(可选),J,C基因, 这么…
接着，访问Bio智慧芽生物序列数据库查询（bio.zhihuiya.com），免费注册账号后，通过数据库首页的药物/基因索引模块，根据抗体名称检索。若该抗体序列已公开，一键搜索即可获取序列信息。对于较早期的抗体药物序列，可以选择Analytics专利数据库查询（zhihuiya.com/analytics）。在新药情报库中找到抗体药物的原研...