以树叶为例(File->Open Samples->Leaf): 打开Surface Plot,会出现报错,需要先把图像转换成8-bit,再打开Surface Plot,会出现下面的三维坐标系: 长宽分别代表x和y轴,z轴为灰度值,可见在尺子和树叶处出现了明显的“凹陷”,但是这图片是不可以旋转的,如果想要得到旋转的图,需要使用3D Surface Plot。 3、Analyze->...
点击“RGB”可以展示加权之后的直方图以及各通道下的直方图,直方图数据可以复制粘贴出来。 可以把像素的灰阶信息可视化出来:Image J-Type-8-bit把图片转成8-bit(或者其他单通道图片模式)之后,Analyze-Surface Plot,获得一张像素灰阶值的三维效果图: 或者选择Analyze-3D Surface Plot,做一个3D交互展示: 参数很简单,玩...
此外,这种伪彩映射似乎是全局性的,打开3D Surface Plot,同样被上了伪彩。 点击菜单栏Image->Color->Display LUTs可查看伪彩色的映射关系。 查看剖面 通过快捷键Ctrl+K,或者菜单栏Analyze->Plot Profile,可以查看选中区域的像素灰度值曲线。如果用直线选择,那么X轴表示沿线的距离,Y轴表示像素强度;如果用矩形框选,那...
得到共定位散点图,散点图越接对角线共定位程度越高: 散点图颜色的深浅代表其出现的频率,Plugins -> 3D -> Interactive 3D Surface Plot可以直观的显示: 而双尾分叉形状的散点图共定位效果差: 除散点图外Colocalization Finder还可以得到定量数据: 定量数据解释如下: 这么多定量数据我们该如何选择? Pearson’s相...
散点图颜色的深浅代表其出现的频率,Plugins -> 3D -> Interactive 3D Surface Plot可以直观的显示: 而双尾分叉形状的散点图共定位效果差: 除散点图外Colocalization Finder还可以得到定量数据: 定量数据解释如下: 这么多定量数据我们该如何选择? Pearson’s相关系数(PCC),两通道之间的强度分布关系; ...
长宽分别代表x和y轴,z轴为灰度值,可见在尺子和树叶处出现了明显的“凹陷”,但是这图片是不可以旋转的,如果想要得到旋转的图,需要使用3D Surface Plot。 3、Analyze->3D Surface Plot 正面是这样的 侧面是这样的 这种三维坐标系能更加清楚和直观地看到,图像的像素分布以及灰度分布情况,就能发现更多的细节。
散点图颜色的深浅代表其出现的频率,Plugins -> 3D -> Interactive 3D Surface Plot可以直观的显示: 而双尾分叉形状的散点图共定位效果差: 除散点图外Colocalization Finder还可以得到定量数据: 定量数据解释如下: 这么多定量数据我们该如何选择? Pearson’s相关系数(PCC)...
4、Plugins -> 3D -> Interactive 3D Surface Plot 可显示 3D Surface 效果: 文献中有用这种效果显示荧光强度强弱: 5、Analyze -> Tools -> Calibration Bar 可添加 Color Bar: 今天给大家分享利用瓜子学习 ImageJ 就到此为止了,希望对大家有所帮助!
此外,Image -> Color -> Edit LUT 双击每个色阶可以编辑自己需要的 LUT(如 141): 4、Plugins -> 3D -> Interactive 3D Surface Plot 可显示 3D Surface 效果: 文献中有用这种效果显示荧光强度强弱: 5、Analyze -> Tools -> Calibration Bar 可添加 Color Bar:...
通过Plugins -> 3D -> Interactive 3D Surface Plot可以直观地显示散点图。 5. 解读共定位分析结果 定量数据:Colocalization Finder插件还提供了一系列定量数据,包括Pearson’s相关系数(PCC)、Manders重叠系数(MOC)等。 PCC:描述两通道之间的强度分布关系。 MOC:反映共定位的真实程度。 共定位像素: 在红色...