简单介绍这半个月抽空实现的一个小工具,IGV-GSAman,可用于快速高效开展大规模基因结构注释矫正工作。, 视频播放量 7892、弹幕量 10、点赞数 167、投硬币枚数 94、收藏人数 360、转发人数 99, 视频作者 生信石头, 作者简介 不会Coding的农民,不是好的吃货,相关视频:进化
GSAman 安装器直接附带了 BLAT 可执行程序(支持Windows和MacOS)。相比于IGV原始版本多年未解决且可能未计划解决的基因组浏览器中序列查找痛点,GSAman增加了相应选项和功能。用户可在主菜单「View」->「Preference」->「Advanced」勾选「Local BLAT」选项,从而启用本地 BLAT 功能(注意:无需自行安装BLAT,GSAman已经全...
GSAman 安装器直接附带了 BLAT 可执行程序(支持Windows和MacOS)。相比于IGV原始版本多年未解决且可能未计划解决的基因组浏览器中序列查找痛点,GSAman增加了相应选项和功能。用户可在主菜单「View」->「Preference」->「Advanced」勾选「Local BLAT」选项,从而启用本地 BLAT 功能(注意:无需自行安装BLAT,GSAman已经全...
GSAman 安装器直接附带了 BLAT 可执行程序(支持Windows和MacOS)。相比于IGV原始版本多年未解决且可能未计划解决的基因组浏览器中序列查找痛点,GSAman增加了相应选项和功能。用户可在主菜单「View」->「Preference」->「Advanced」勾选「Local BLAT」选项,从而启用本地 BLAT 功能(注意:无需自行安装BLAT,GSAman已经全...
IGV的使用痛点之一,是无法直接复制CDS或者mRNA序列。在GSAmanTrack中,鼠标右键菜单中可以直接支持。 支持异常外显子边界自动检测 GSAman中调整外显子边界,可以开启边界序列模式自动检测功能,可以辅助更好进行基因结构注释矫正的优化。 展示丰富的注释信息 在GSAman中,支持自定义展示的注释信息,以及标注信息,方便进行数据...
IGV从「GSAman」到「GSAwoman」,加速1000倍!支持大基因组~也没想到就这样搞定了直接从内存操作然后另开一个线程间隔5min自动导出到文件 IGV从「GSAman」到「GSAwoman」,加速1000倍!支持大基因组~ 转眼就是 10月16日。每每如此,写一个小工具,总是计划两三个小时写完,然后就这样。后来优化优化再优化,这样半个...
IGV-GSAman 的安装与使用 Windows 或者是 MacOS 用户,直接双击安装器安装即可。 安装完成后,直接双击图标即可打开, 弹出界面,与 IGV 官方版本完全一致。解压示例数据,可以看到具体文件 按照常规使用,我们直接导入 IGV 就可以看到 而要使用 GSAman 功能,那么非常简单,直接给 GFF3 或者 GTF 注释信息文件添加 .gsama...
IGV | 从「GSAman」到「GSAwoman」,加速1000倍!支持大基因组~ 转眼就是 10月16日。每每如此,写一个小工具,总是计划两三个小时写完,然后就这样。后来优化优化再优化,这样半个月也就过去。 IGV-GSAman在处理绝大多数物种基因组上,速度已经足够快了。不过出乎意料的,还是有朋友联系过来,说确实不快。聊了一下...
人工矫正基因结构注释神器-IGV-GSAman 该网站使用了框架技术,但是您的浏览器不支持框架,请升级您的浏览器以便正常访问。人工矫正基因结构注释神器-IGV-GSAman
《GSAman | 基因结构精细化注释工具,持续优化,体验加倍》 《GSAman | 人工矫正注释,加速>300倍,支持转录本灵活操作》 《Coding,永远不要太相信你的能力》 《IGV | 从「GSAman」到「GSAwoman」,加速1000倍!支持大基因组~》 《GSAman | 「时光机」!人工矫正基因结构注释神器新特性~》 ...