2-1 邻接矩阵转图:graph_from_adjacency_matrix 可以接受Matrix包创建的稀疏矩阵作为参数 邻接矩阵中行的顺序被保留,并作为图中顶点的顺序。 本函数几个重要的参数: weighted:如果值是NULL,图是无权图,矩阵中的数字定义的是对应顶点间边的数量。 > par(mfrow=c(1,2)) > adjm <- matrix(
### 2.2 确定相关性关系 保留p<=0.05且abs(r)>=0.6的变量间相关关系 #cor.r[abs(cor.r) < 0.6 | cor.p > 0.05] = 0 #cor.r = as.matrix(cor.r) #g = graph_from_adjacency_matrix(cor.r,mode = "undirected",weighted = TRUE,diag = FALSE) ### 将数据转换为long format进行过滤...
adjm <- matrix(sample(0:1, 100, replace=TRUE), nc=10) g1 <- graph_from_adjacency_matrix( adjm ,mode = "upper", weighted = NULL) ad <- matrix(sample(0:1, 25,replace=TRUE),nc = 5) g2 <- graph_from_adjacency_matrix(ad, mode = "upper",weighted = NULL) view(g1)正常看到...
其中,adj_matrix是一个邻接矩阵,表示节点之间的连接关系;graph_from_adjacency_matrix函数将邻接矩阵转换为igraph对象。 二、节点和边的操作 在igraph中,可以通过各种方法对网络的节点和边进行操作。例如,我们可以使用如下代码获取网络的节点数和边数: ```R num_nodes <- vcount(graph) num_edges <- ecount(graph...
(1) > g=graph(c(1,2,5,6,1,4),n=6,directed=T) > plot(g) (2) >g=graph.formula(Alice-Bob-Cecil-Alice,Daniel-Cecil-Engene,Cecil-Gordon) > plot(g) (3) graph.data.frame() #从数据框画图 graph.adjacency() #从邻接矩阵创建图 (4) erdos.renyi.game() #根据Erdos-Renyi模型生成随机...
igraph <- graph_from_adjacency_matrix(occor.r,mode="undirected",weighted=TRUE,diag=FALSE) E(igraph)$weight edglist$weight = E(igraph)$weight edges <- data.frame(plotcor[edglist[,1], ], plotcor[edglist[,2], ]) head(edges)
adj_matrix <- matrix(c(0, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 0), nrow=4, byrow=TRUE) g_adj <- graph_from_adjacency_matrix(adj_matrix, mode="undirected", diag=FALSE) plot(g_adj) 在这个例子中,mode 参数指定了图的类型("undirected" 表示无向,"directed" 表...
igraph <- graph_from_adjacency_matrix(occor.r,mode="undirected",weighted=TRUE,diag=FALSE) E(igraph)$weight edglist$weight = E(igraph)$weight edges <- data.frame(plotcor[edglist[,1], ], plotcor[edglist[,2], ]) head(edges)
igraph中有很多用于创建图的函数，有确定性的，也有随机的;随机图构造器称为‘games’。要从字段数据创建图，graph_from_edgelist、graph_from_data_frame和graph_from_adjacency_matrix可能是最好的选择。igraph包括一些经典的随机图，如Erdos-Renyi GNP and GNM graphs (sample_gnp, sample_gnm)，以及...
adj_matrix <- matrix(c(0, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 0), nrow=4, byrow=TRUE) g <- graph_from_adjacency_matrix(adj_matrix, mode="undirected", diag=FALSE) 四、基本操作 1. 添加和删除顶点及边 添加顶点: V(g)$name <- c(V(g)$name, "E") 删...