(仅供参考)Icimapping 连锁图中文操作说明
Icimapping QTL中文操作说明MAPChinese
选择好.met文件后,点击打开,文件就导入了ICIMapping中,会出现在控制面板中,如下: 面板分为两个部分,上半部分是导入的数据,下边为进行QTL定位参数设置的控制界面: 控制界面包含Step(cM):扫描步长;PIN:标记进入模型的概率水平; LOD Threshold:LOD阈值;Mapping Method:ICIM-ADD和ICIM-EPI两种(选择ICIM-EPI)。 参数设...
icimapping和joinmap的区别是,两者的计算速度不一样。因为icimapping用的是高斯算法,而joinmap用的是柯西算法,所以两者的计算速度不一样
1.打开软件打开软件: QTL IciMapping 软件可通 过两种方式打开 双击QTL IciMapping 软件在桌 面上的快捷图标 从”所有程序”菜单中选择QTL IciMapping 软件 2.软件浏览软件浏览. 单击StartPage中的中的”左箭头左箭头”或 ”右箭头右箭头”, 可以看到: 软件所能处理的遗传群体类型 共显性标记是如何编码的 显性...
软件QTL IciMapping 4.1 步骤一 软件运行前的准备工作 1 在excel中整理基因型数据和表型数据。基因型数据按如下整理,所有引物在第一行,所有样品在第一列,将基因型用特定数字替换并保存;表型数据按如下整理如所有性状名称在第一行,所有样品在第一列,将表型数据录入 2 分别将基因型数据和表型数据转置并保存 ...
打开软件: QTL IciMapping 软件可通 过两种方式打开 • 双击QTL IciMapping 软件在桌 面上的快捷图标 • 从”所有程序”菜单中选择QTL IciMapping 软件 2. 软件浏览. 单击StartPage 中的”左箭头”或”右箭头”, 可以看到: • 软件所能处理的遗传群体类型 • 共显性标记是如何编码的 • 显性标记是...
1. 打开软件: QTL IciMapping 软件可通过两种方式打开 • 双击QTL IciMapping 软件在桌面上的快捷图标 • 从”所有程序”菜单中选择QTL IciMapping 软件 2. 软件浏览. 单击StartPage 中的” 左箭头”或” 右箭头”, 可以看到: • 软件所能处理的遗传群体类型 • 共显性标记是如何编码的 • 显性标记...
ICAA文件:复合区间作图二维扫描的加性效应下三角矩阵文件 ICLD文件:复合区间作图二维扫描的lod值下三角矩阵文件 MTP文件:marker 分型频率、偏分离卡方检验、缺失marker分型估计 RICE文件:复合区间作图二维扫描结果文件 QICE文件:复合区间作图识别两个基因上位性QTL文件 STA文件:基本的表型数据统计文件 ST...
Icimapping QTL中文操作说明MAPChinese 双亲群体的QTL作图 (BIP) 请注意: 开始之前, 请确认您的计算机已安装了QTL IciMapping集成软件! 1. 打开软件: QTL IciMapping 软件可通过两种方式打开 ? 双击QTL IciMapping 软件在桌面上的快捷图标 ? 从”所有程序”菜单中选择QTL IciMapping 软件 2. 软件浏览. 单击...