...使用应用于 TCGA-LIHC 队列的公式计算 ICGC-LIRI-JP 队列患者的 TCscore,以验证 GSTTKs 特征的预后能力。...TCGA-LIHC 队列(训练集)和 ICGC-LIRI-JP 队列(测试集)中的 AUC 值分别为 0.724和0.729(图 6A、B)。...单因素和多因素 cox 回归分析表明,TCscore 是 TCGA-LIHC(图 6
donor.LIRI-JP.tsv.gz 病人的数据(临床数据)exp_seq.LIRI-JP.tsv.gz 表达数据(测序数据)sample.LIRI-JP.tsv.gz 样品信息simple_somatic_mutation.open.LIRI-JP.tsv.gz 突变数据specimen.LIRI-JP.tsv.gz 实验处理数据(可以区分正常和癌症)structural_somatic_mutation.LIRI-JP.tsv.gz 结构变异数据转...
原始数据 exp_seq.LIRI_JP.tsv 处理后数据 normalization matrix raw read counts matrix 代码 #!/usr/bin/perlusewarnings;usestrict;open(EXP,'exp_seq.LIRI-JP.tsv')ordie$!;open(NORM,'>exp_norm_matrix.LIRI-JP.tsv');open(RAW,'>exp_raw_matrix.LIRI-JP.tsv');my%hash_norm;my%hash_raw;my%...