如何用GraphPad Prism绘制剂量反应曲线? 上图是Sci文献中的dose–response curves (剂量反应曲线),横坐标是药物GS-Se-SG浓度的对数值,纵坐标是Rrelative cell viability(相对细胞活性,% of control),从图注中可以知道IC50为5.… 酸菜发表于解螺旋 GRAPHPAD作图技巧(二)--拟合曲线 计算药物半抑制浓度IC50的拟合曲线图...
一般 IC50 曲线的浓度是需要经过 log10 转换才会出现特征的S 型或者倒 S 型曲线(Sigmoid 型,取决于是杀细胞还是保护细胞效应),所以刻度的间隔不是均匀的,而是成倍数增加的。此图的刻度是经过 log10转换再反转之后的刻度。 IC50 曲线的浓度经过log转换后,曲线都会呈现倒 S 型(或者 S 型),IC50对应的浓度会根据...
所以还是用Origin来拟合标准曲线,然后用origin内置功能来计算IC50比较方便。 这里使用Origin7.5来作演示。 1.先随意输入一组数据吧 ? 2.选中这2列数据,然后点左下角的作scatter图的图标, ? ? 3.然后就生成了散点图 ? 4.点击Analysis菜单中的FitPolynomial,在弹出的对话框中,Order处设为1,这样就是作线性拟合,...
IC50指的是产生50%抑制/可测量效果所需的抑制剂浓度,它是一个综合性的结果参数,对测定条件高度敏感,不应仅从分子角度来解读。而IC90和IC99则表示接近完全抑制的状态,通常可以通过直接拟合或利用方程式进行估算。其中,X代表抑制百分比,h则是曲线线性部分的Hill系数,即斜率。而IC50,那个产生50%抑制/可测量效果...
r语言ic50曲线 在R语言中绘制IC50曲线,通常涉及到将实验数据拟合成量效关系模型,并基于模型参数计算出IC50值(即半抑制浓度),然后利用这些数据和计算结果绘制图形。以下是一个简化的示例流程: 1、数据准备: 你需要有一组药物浓度与响应度的数据,例如,每个浓度下测定的细胞存活率或者酶活性等。 2、拟合模型: 常用的...
IC50曲线是由一系列浓度-反应曲线构成的,通过测定不同浓度下的生物反应值(如细胞生长抑制率、酶活性等),然后利用回归分析得到IC50值,再将IC50值与药物浓度进行绘图得到IC50曲线。 二、IC50曲线的构建方法 1. 实验设计 IC50曲线的构建需要进行一系列的实验,首先需要选择合适的生物指标,如细胞生长抑制率、酶抑制率等。
GraphPad Prism是一个强大的工具,用于绘制量效关系曲线并计算IC50值。以下是如何操作的步骤:首先,以MTT实验数据为例,处理得到细胞存活率的数据。然后,在Prism中,选择"XY"图表类型,输入数据并设置重复值。接下来,将浓度转换为对数形式以优化图形。通过"Nonlinear regression"进行曲线拟合,选择"Variable...
可以重新来。计算药物半抑制浓度IC50的拟合曲线图的做法:1、使用的版本是GraphpadPrism5,打开软件后,选择XY作图方式。2、将实验所得的数据填写入图表中,注意x轴写入的是log[药物],比如说你加入的药物浓度分别为1-100000nM,那首先你必须先将这个浓度进行换算,一个有效的方法就是在Excel中进行计算,...
近期,《Journal of Medicinal Chemistry》杂志讨论了剂量响应曲线的测定,效力和构效关系时使用 IC50值的注意事项,并鼓励使用 pIC50± SEM 来报告数据。 1. 剂量反应模型:简介 早期药物发现的优化依赖于小分子苗头化合物的药物化学修饰,以提高所需反应(抑制、激活、途径/生物标志物调节)的效力和功效。这些研究旨在评估...
IC50曲线测试实验流程 IC50曲线的测定 IC50即半抑制率,标准曲线是一个S型曲线。IC50为50%抑制浓度即细胞存活量为对照样本一半时所对应的浓度,半数抑制越低,说明药物对细胞的毒性越高。实验操作步骤如下:1.细胞准备:A.细胞状态检测:从培养箱中取出细胞,显微镜下观察。状态描述:观察结果,细胞汇合度:B....