全面介绍HPA(Human Protein Atlas)数据库, 视频播放量 1188、弹幕量 0、点赞数 23、投硬币枚数 6、收藏人数 73、转发人数 8, 视频作者 生信交流平台, 作者简介 生信博士,分享生信技能。合作请联系:,相关视频:STRING寻找相互作用基因,WGCNA共表达网络—核心基因筛选,
The Human Protein Atlas(HPA)是一个提供近30000种人类蛋白质的组织和细胞分布信息的数据库,可免费查询。 定义与概述 The Human Protein Atlas(简称HPA)是一个由瑞典Knut & Alice Wallenberg基金会于2003年创建的综合性数据库。该数据库的核心目标是提供涵盖全部24000多种人类蛋...
这数据库,我王多余学了。 THE HUMAN PROTEIN ATLAS,简称HPA,分为Cell,Tissue和Pathology三个版块,分别展示了蛋白在细胞、正常组织和癌变组织中的表达情况。 我以ITGB6为例,实操如何不做实验产数据。 打开https://www.proteinatlas.org/,在搜索框中输入ITGB6,点击search 点击图中绿色的Cell,进入该版块。 此版块分...
Pathology Atlas:前面类似,包含general information, Human protein atlas information,增加了免疫组化信息,如数据可靠性,证据等级及相关抗体。在Pathology Atlas,可以看到该项目在不同肿瘤预后概要,通过颜色区分,粉红色为高表达,蓝色为低表达,两组预后生存率是否存在差异。另外也关联了该基因在TCGA数据库中信息,在不同肿...
human protein atlas数据库使用原则Human Protein Atlas数据库的使用原则包括以下几个方面: 1.免费查询:HPA数据库对公众是免费开放的,用户可以通过网站查询和浏览数据库中的信息。 2.数据共享:HPA数据库中的数据是公开共享的,用户可以自由地使用和引用数据库中的数据,但需要遵守相关的数据使用规定和知识产权保护法律。
Human Protein Atlas 数据库,它致力于提供全部24,000种人类蛋白质的组织和细胞分布信息,并免费提供公众查询。创立这个数据库的瑞典 Knut & Alice Wallenberg基金会使用特制的抗体,用免疫组化的技术,检查每一种蛋白质在48种人类正常组织,20种肿瘤组织,47个细胞系和12种血液细胞内的分布和表达,其结果用至少576张免疫...
我们在进行基因的蛋白表达检测的时候,通常的方法是进行western blot以及免疫组化进行检测的。对于这两个实验都是需要提前买抗体进行检测的,但是抗体又贵,如果一个基因检测的结果不好的话,那有可能就要浪费这个抗体了。所以今天就来介绍一个,在很多癌症当中做了很多基因的免疫组化的数据库: The Human Protein Atlas ...
数据库名为Human Protein Atlas,传送门:https://www.proteinatlas.org/。 Human Protein Atlas(HPA)提供了26000种人类蛋白质的组织和细胞分布信息。在该数据库中,研究人员使用高度特异性的抗体,用免疫检测技术(免疫印迹、免疫荧光和免疫组化),详细地检测了每一种蛋白在64个细胞系、48种人类正常组织和20种肿瘤组织...
The Human Protein Atlas contains images of histological sections from normal and cancer tissues obtained by immunohistochemistry. Antibodies are labeled with DAB (3,3'-diaminobenzidine) and the resulting brown staining indicates where an antibody has bound to its corresponding antigen. Check https://...
在一些纯生信分析的文章里,最后往往需要利用Human Protein Atlas(HPA)数据库来对目标基因进行蛋白表达水平的验证。但是,直接从HPA下载的免疫组化图片往往比较单调,缺乏对结果细节的展示,比如这样: 但是高分文献里展示的图片却长这样: 是不是高级了许多,是不是感受到了差距…没关系,今天小编手把手教会你,用PS绘制高级...