https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/ PubChem是一个有机小分子生物活性数据库,是一个生环化材中应用分子的数据模型库。这里面包含了大量分子材料的理化性能介绍,对应每个有机分子的应用都能够追根溯源到较为全面的文献报道。可以按名称,分子式,结构和其他标识符搜索化学物质来查找化学和物理性质,生物活性,安全性和...
1.1牡荆苷的潜在靶点筛选 通过PubChem(https://pubchem.ncbi.nlm.nih. gov/)数据库得到牡荆苷的3D结构和SMILES格式文件,利用Chem3D 20.0对牡荆苷的3D结构进行能量最小化。综合利用TCMSP[15](https://old. tcmsp-e.com/tcmsp.php)、Pharm Mapper[16-19](http:// www.lilab-ecust.cn/pharmmapper/)、SEA[2...
1.1土大黄活性成分及靶点筛选 由于中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库未收录“土大黄”,查阅相关文献收集土大黄化学成分,将化学成分通过PubChem数据库(https:// pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/)检索土大黄化学成分的Canonical SMILES号,导入SwissTarget Prediction平台(http://www.swisstargetprediction.ch/)进行...
1.1丹参酮II A作用靶点预测 在PubChem数据库(https://pubchem.ncbi.nlm. nih.gov/)获取丹参酮II A的sdf结构文件,上传至SwissTargetPrediction数据库(http://www.swiss targetprediction.ch/)和PharmMapperServer平台(http://lilab-ecust.cn/pharmmapper/index.html)预测丹参酮II A的作用靶点。运用中药系统药理学...
在Pubchem(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/)数据库中,查询相应成分的Smile号,导入Swiss5 ADME分析平台[12],以GI absorption项为High,Durg likeness项满足2项为Yes为条件,筛选活性成分,导入SwissTaregetPrediction数据库,选取Probability≥0.1的靶点作为药物靶点数据库[13-14]。
1.3.1数据库公共化学数据库(Public Chemical Database,Pubchem,https://pubchem.ncbi.nlm.nih. gov/);瑞士目标预测数据库(Swiss Target Prediction,http://www. swisstargetprediction.ch/);通用蛋白质资源数据库(UniProt,https://www. uniprot.org/);基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO,https://ww...
TCMSP数据库(https://www.tcmsp-e.com/)、PubChem数据库(https://pubchem.ncbi.nlm.nih. gov/)、SwissTargetPrediction数据库(http://swiss targetprediction.ch/)、UniProt数据库(https://www. uniprot.org/)、GeneCards数据库(https://www.Gene cards.org/)、OMIM数据库(https://www.omim.org/)、NCBI...
美国国家医学图书馆:此处(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/) 美国职业安全与健康管理局专业化学数据库:此处(https://www.osha.gov/chemicaldata/index.html) 从您的化学品供应商采购合规制剂 对于所有制剂,请提供符合现行全球化学品统一分类和标签制度 (GHS) 要求的安全数据表 (SDS) 文件。
PubChem数据库(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/);TCMSP数据库(https://old.tcmsp-e.com/tcmsp.php);Swiss Target Prediction数据库(http://www.swisstargetprediction.ch/);GeneCards数据库(https://www.genecards.org/);String数据库(https://string-db.org/);Venny 2.1.0(http://bioinfogp.cnb.cs...
进入PubChem 网站(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/),检索栏中输入Valproic acid,点击右侧放大镜进行搜索 弹出的界面,点击右侧导航栏中3D conformer即可得到Valproic acid的3D结构图 同样操作可以获取其它预后相关焦亡基因的化合物以及其对应的3D结构 Figure 7:肿瘤微环境与免疫细胞分析 ...