欧洲生物信息学研究所Ensembl基因组浏览器:http://www.ebi.ac.uk/ensembl/index.html 欧洲生物信息学研究所Thornton研究组:http://www.ebi.ac.uk/Thornton/index.html 欧洲生物信息学研究所多序列联配数据库: http://www.ebi.ac.uk/embl/Submission/alignment.html 欧洲生物信息学研究所工具箱:http://www.ebi...
根据以下检索结果说明该蛋白质结构在PDB数据库中的编号为___,其结构测定方法为___。http:/www.rcsb.org/pdb/results/results.do链接PDBA MEMBER OF THEAn Information Portal to Biological Macromolecular StPROTEIN DATA BANKAs of Tuesday Oct 07, 2008there are 53521 Structures PDB SCONTACT US |HELP |PRINT...
1.6.6分子对接验证结合实验结果并参考现有文献,选取三七中含量最高和最主要的成分,从PubChem数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ pccompound)中下载相应的sdf格式文件。从PDB数据库(https://www.rcsb.org/)和Uniprot数据库(http://www.uni-prot.org/)下载核心靶点的高解析精度(<0.250 nm)蛋白质三维结构数...
从PubChem数据库中下载“1.3”项构建的“成分-靶点-疾病”网络中度值排名前3的关键成分的SDF文件,作为配体文件。在Protein Data Bank数据库(http://www.rcsb.org/)下载“1.4”构建的PPI网络中度值排名前5的核心靶点的PDB结构,作为受体文件。利用AutoDock Tools 1.5.7对受体进一步加氢、去水等处理,使用Autodock Vi...
通过PDB数据库(https://www.rcsb.org/)[25]获取关键靶点的蛋白晶体结构,并以PDB格式保存。从PubChem网站下载黄芪甲苷的3D结构作为配体,先用ChemBioOffice 2014软件将黄芪甲苷3D结构能量最小化并保存为mol2格式。使用PyMOL 2.4软件对受体蛋白进行去水,去配体和加氢等操作,并保存。然后将处理后的受体蛋白与黄芪甲...
通过RCSB PDB数据库(https://www.rcsb.org/)获得靶点蛋白三维晶体结构的pdb格式,通过PubChem数据库(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/)获得活性成分二维结构的sdf格式,后用Chem 3D 22.0.0打开sdf格式,并转化为mol2格式保存。应用Pymol软件对靶点蛋白进行去除溶剂、配体等预处理,使用AutoDock软件对靶点蛋白进行...
1.6.6分子对接验证结合实验结果并参考现有文献,选取三七中含量最高和最主要的成分,从PubChem数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ pccompound)中下载相应的sdf格式文件。从PDB数据库(https://www.rcsb.org/)和Uniprot数据库(http://www.uni-prot.org/)下载核心靶点的高解析精度(<0.250 nm)蛋白质三维结构数...
在Protein Data Bank数据库(http://www.rcsb.org/)下载“1.4”构建的PPI网络中度值排名前5的核心靶点的PDB结构,作为受体文件。利用AutoDock Tools 1.5.7对受体进一步加氢、去水等处理,使用Autodock Vina 1.5.6进行15次分子对接并计算结果。 2霍山石斛水提物对酒精致肝损伤小鼠的影响...
http://www.pdb.bnl.gov or http://www.rcsb.org/pdb/; 27.化学领域多来米站: http://csite.myrice.com/weblink.html; 28.一个提供各种英文网站: http://www.abc.chemistry.bsu.by/current/fulltextj.htm; 29.有机反应机理大全: http://www.infochembio.ethz.ch/l ... eaktionen_lehr.html; ...
中国星火信息网(http://www.cnsp.org.cn/) 国家自然科学基金委员会(http://www.nsfc.gov.cn) 国家重点基础研究发展规划(http://www.973.gov.cn/) 国家生产力促进中心(http://www.cppc.gov.cn/) 国家科技型中小企业技术创新基金(http://www.innofund.gov.cn/index.asp) ...