北京大学生物信息学中心:http://www.cbi.pku.edu.cn/ 北京大学生物信息中心(CBI)成立于1997年,是欧洲分子生物学网络组织EMBnet的中国国家接点。几年来,已经与多个国家的生物信息中心建立了合作关系。目前是国内数据库种类最多,数据量最大的生物信息站点。在基因预测、基因组、蛋白质结构等领域都有相应的研究项目。
随着多组学技术的不断进步和基于海量生物学数据的生物信息方法及工具的快速发展,植物科学包括作物科学研究进入了大数据时代。对于所有开展植物科学相关研究的科研工作者和学生群体而言,各类数据库和分析平台的建立和更新维护为植物多组学、基因功能及调控网络、系统发育、进化以及遗传育种等方面研究提供了丰富的资源,具有重要...
利用KOBAS数据库(http://kobas.cbi.pku.edu. cn/)进行KEGG通路富集分析,揭示淫羊藿素治疗多发性骨髓瘤的关键通路。校正后P<0.05为显著富集。 1.4分子对接 首先从PubChem数据库(https://pubchem.ncbi. nlm.nih.gov/)下载淫羊藿素的化学结构式文件,然后导入Chem 3D(v15.0)软件生成3D化学结构并使其能量最小化。...
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http://www.pathoplant.de 植物-病原体相互作用的信号转导相关物质成分数据库 http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn/ 植物转录因子数据库 http://plntfdb.bio.uni-potsdam.de/v3.0/ 植物转录因子数据库 http://psorf.whu.edu.cn/ 植物小型开放阅读框架(sORF)数据资源库 ...
http://www.drastic.org.uk 植物细胞的信号转导分析数据库 http://www.pathoplant.de 植物-病原体相互作用的信号转导相关物质成分数据库 http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn/ 植物转录因子数据库 http://plntfdb.bio.uni-potsdam.de/v3.0/ 植物转录因子数据库 ...
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http://structuralbiology.cau.edu.cn/SIFGD/ WheatNet (面包小麦的全基因组规模功能基因网络数据库) https://www.inetbio.org/wheatnet/ EasyGo (提供一系列待查基因的功能注释以及微阵列探针信息) http://bioinformatics.cau.edu.cn/easygo/ NGS & sRNA Tools {二代测序(NGS)数据库,包括植物的RNA和基因组信...
http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn/ http://plntfdb.bio.uni-potsdam.de/v2.0/ 拟南芥转库因子数据库 http://urgv.evry.inra.fr/CATdb 动物转录因子数据库 http://bioinfo.life.hust.edu.cn/AnimalTFDB#!/species 人与鼠转录因子数据库