1、HTSeq是对有参考基因组的转录组测序数据进行表达量分析的,其输入文件必须有SAM和GTF文件。 2、一般情况下HTSeq得到的Counts结果会用于下一步不同样品间的基因表达量差异分析,而不是一个样品内部基因的表达量比较。因此,HTSeq设置了-a参数的默认值10,来忽略掉比对到多个位置的reads信息,其结果有利于后续的差异...